More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0583 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0486  transposase  100 
 
 		 348 aa  725    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  100 
 
 		 348 aa  725    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  92.53 
 
 		 348 aa  674    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  92.51 
 
 		 231 aa  442  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  57.76 
 
 		 403 aa  437  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  58.33 
 
 		 403 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  58.05 
 
 		 403 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  60.47 
 
 		 411 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  57.18 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  59.94 
 
 		 411 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  57.31 
 
 		 402 aa  428  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  57.88 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  58.45 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  58.17 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  58.17 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  57.88 
 
 		 402 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  57.88 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  57.88 
 
 		 402 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  57.31 
 
 		 402 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  57.31 
 
 		 402 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  57.88 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  55.59 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  59.3 
 
 		 411 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  58.89 
 
 		 411 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  90.87 
 
 		 219 aa  417  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  57.59 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  57.59 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  57.02 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  58.26 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  57.1 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  51.85 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  51.59 
 
 		 431 aa  378  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  52.25 
 
 		 422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  50 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  49.4 
 
 		 381 aa  315  9e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  49.4 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  44.29 
 
 		 435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  40.97 
 
 		 422 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  43.77 
 
 		 408 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  43.21 
 
 		 408 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0667  transposase  87.6 
 
 		 134 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000584643  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0716  transposase  82.17 
 
 		 164 aa  225  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0633864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.87 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  35.17 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  34.36 
 
 		 397 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  34.36 
 
 		 397 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  34.88 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  34.4 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  34.59 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  34.88 
 
 		 372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.59 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.3 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.3 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.3 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  34.59 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  36.29 
 
 		 440 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  33.71 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  32.74 
 
 		 417 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  35.49 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  33.43 
 
 		 370 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  32.86 
 
 		 363 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  33.8 
 
 		 424 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  32.68 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  35.59 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  34.12 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.28 
 
 		 396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  32.86 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  37.8 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  32.29 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  32.29 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.95 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  34.28 
 
 		 383 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  34.6 
 
 		 383 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.14 
 
 		 401 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  32.73 
 
 		 415 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  32.75 
 
 		 399 aa  185  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  36.83 
 
 		 384 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  32.01 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  32.01 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.19 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  31.73 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  32.01 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 383 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  32.01 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  33.99 
 
 		 383 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  33.9 
 
 		 381 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  33.15 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  34.18 
 
 		 390 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  33.9 
 
 		 416 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.28 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  35.85 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  35.35 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  32.95 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  32.95 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  31.12 
 
 		 362 aa  176  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  34.8 
 
 		 383 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  34.57 
 
 		 377 aa  175  9e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  34.8 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>