More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5398 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5398  transposase  100 
 
 		 422 aa  859    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  43.1 
 
 		 402 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  43.65 
 
 		 400 aa  352  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  43.47 
 
 		 402 aa  352  8e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  42.86 
 
 		 402 aa  352  8e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  43.71 
 
 		 402 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  42.86 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  42.99 
 
 		 402 aa  351  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  43.23 
 
 		 402 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  43.23 
 
 		 402 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  42.99 
 
 		 402 aa  349  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  42.11 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  42.28 
 
 		 402 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  42.99 
 
 		 402 aa  346  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  46.2 
 
 		 406 aa  345  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  44.3 
 
 		 387 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0079  IS605 family transposase OrfB  94.44 
 
 		 241 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  42 
 
 		 413 aa  343  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  45.11 
 
 		 403 aa  343  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  43.06 
 
 		 411 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  44.57 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  44.57 
 
 		 403 aa  339  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  43.07 
 
 		 382 aa  335  7e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  43.07 
 
 		 382 aa  335  7e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  41.77 
 
 		 411 aa  335  7.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  41.63 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  41.57 
 
 		 411 aa  330  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  41.29 
 
 		 411 aa  330  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  45.39 
 
 		 431 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  41.12 
 
 		 399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  41.3 
 
 		 381 aa  296  6e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  41.04 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0078  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  93.24 
 
 		 153 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  41.65 
 
 		 408 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  41.65 
 
 		 408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  39.76 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  41.38 
 
 		 348 aa  276  7e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  40.97 
 
 		 348 aa  272  8.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  40.97 
 
 		 348 aa  272  8.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  37.47 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  37.47 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.49 
 
 		 435 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  36.14 
 
 		 424 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.22 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.48 
 
 		 401 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.73 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  36.56 
 
 		 399 aa  209  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  36.56 
 
 		 399 aa  209  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  35.05 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.29 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  32.86 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  32.94 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  46.46 
 
 		 231 aa  204  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  34.51 
 
 		 416 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  32.2 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  34.42 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.16 
 
 		 391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  36.04 
 
 		 399 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  32.07 
 
 		 391 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  30.62 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  46.05 
 
 		 219 aa  196  6e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  37.06 
 
 		 398 aa  196  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  36.13 
 
 		 398 aa  196  9e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  36.13 
 
 		 398 aa  196  9e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  33.51 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  32.94 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  34.19 
 
 		 417 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  35.71 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.71 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  36.71 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.48 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  35.85 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.48 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  33.78 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.52 
 
 		 361 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.44 
 
 		 395 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.71 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  32.7 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.54 
 
 		 406 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  29.38 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  33.8 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.7 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.13 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  31.9 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  31.9 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.45 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  32.65 
 
 		 385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  32.75 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  36.54 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.38 
 
 		 370 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  33.17 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  30.23 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  31.61 
 
 		 385 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  30.29 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  30.29 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  32.12 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  31.85 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  33.78 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  30.99 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.68 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>