More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7257 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  86.47 
 
 		 399 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  85.21 
 
 		 399 aa  663    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  87.19 
 
 		 406 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  95.24 
 
 		 399 aa  744    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 399 aa  803    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  73.18 
 
 		 399 aa  568  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  73.18 
 
 		 399 aa  568  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  44.6 
 
 		 361 aa  286  4e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  43.04 
 
 		 373 aa  276  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  40.36 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  40.1 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2680  transposase  71.35 
 
 		 229 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  38.66 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  39.38 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  39.95 
 
 		 380 aa  229  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  39.43 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  39.18 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  36.92 
 
 		 380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  39.18 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3155  transposase, IS605 OrfB family  40.06 
 
 		 338 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  37.89 
 
 		 466 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1755  transposase, IS605 OrfB family  38.4 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  37.75 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1517  transposase, IS605 OrfB family  37.89 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  37.19 
 
 		 429 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  35.71 
 
 		 422 aa  199  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  33.5 
 
 		 402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  33.5 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  32.65 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  33.5 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  33.5 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  34.01 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  32.37 
 
 		 449 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  33.92 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2570  transposase, IS605 OrfB family  36.21 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373055  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  34.1 
 
 		 422 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  32.9 
 
 		 413 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  33.33 
 
 		 403 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  33.25 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  33.5 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  33.08 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  33.5 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  33.25 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  33.25 
 
 		 387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  33.08 
 
 		 403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.33 
 
 		 406 aa  190  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  33.25 
 
 		 402 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  32.82 
 
 		 402 aa  186  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1741  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  37.5 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  32.74 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  34.1 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  34.1 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  30.35 
 
 		 362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.62 
 
 		 435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  32.22 
 
 		 411 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  32.91 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  31.88 
 
 		 411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  29.77 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  32.15 
 
 		 411 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  32.05 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  33.24 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  29.59 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  33.24 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  36.05 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  36.05 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  29.59 
 
 		 363 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  29.59 
 
 		 363 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  29.59 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  29.77 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  26.9 
 
 		 424 aa  176  6e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  29.59 
 
 		 363 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  29.34 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  29.08 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  29.08 
 
 		 363 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  29.08 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  32.03 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.08 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  31.54 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  27.85 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  26.82 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2046  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.36 
 
 		 424 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  33.02 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  33.02 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  32.08 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  26.3 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.91 
 
 		 431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  27.07 
 
 		 370 aa  166  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  27.32 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1410  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.36 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4522  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.36 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.839734 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  33.83 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1366  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.36 
 
 		 424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0778  transposase, IS605 OrfB family  27.84 
 
 		 500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1600  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.36 
 
 		 424 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39272 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4643  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.36 
 
 		 424 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1337  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.11 
 
 		 424 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  27.32 
 
 		 393 aa  162  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  27.05 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0873  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  33.42 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0586  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.11 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>