More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0778 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0778  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
500 aa  1030    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3183  transposase, IS605 OrfB family  73.6 
 
 
496 aa  763    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  36.11 
 
 
449 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3012  transposase, IS605 OrfB family  32.55 
 
 
395 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  32.17 
 
 
409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  31.53 
 
 
402 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  38.29 
 
 
402 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  38.29 
 
 
402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  33.49 
 
 
402 aa  182  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  37.66 
 
 
402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  37.97 
 
 
402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  37.03 
 
 
402 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  27.61 
 
 
399 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.320804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  37.66 
 
 
402 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  37.66 
 
 
382 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  37.66 
 
 
387 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  37.66 
 
 
402 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  37.66 
 
 
402 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  37.66 
 
 
382 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  37.66 
 
 
402 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  37.66 
 
 
402 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.27 
 
 
406 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  27.15 
 
 
399 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  37.97 
 
 
402 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  28.83 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  28.83 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3581  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  27.47 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  35.08 
 
 
348 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  33.95 
 
 
411 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0373  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  27.47 
 
 
444 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  34.46 
 
 
411 aa  172  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1958  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  26.81 
 
 
440 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0714326  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1931  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  26.81 
 
 
440 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.84 
 
 
399 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  33.54 
 
 
411 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  28.31 
 
 
399 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  33.82 
 
 
348 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  33.82 
 
 
348 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  34.65 
 
 
411 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  33.75 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  33.75 
 
 
381 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  31.67 
 
 
361 aa  167  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  33.13 
 
 
413 aa  166  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  30.94 
 
 
362 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0822  putative transposase IS605 family  28.07 
 
 
411 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0682059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3231  putative transposase IS605 family  28.07 
 
 
411 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963843 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  30.14 
 
 
400 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  31.33 
 
 
363 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  31.33 
 
 
363 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  31.33 
 
 
363 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  31.33 
 
 
363 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  31.33 
 
 
363 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  32.11 
 
 
411 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  31.33 
 
 
363 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2853  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  28.83 
 
 
431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2874  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  28.44 
 
 
427 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3222  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  28.44 
 
 
427 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0393444  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  29.48 
 
 
370 aa  156  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3243  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  28.6 
 
 
431 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  31 
 
 
403 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  31.07 
 
 
363 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  31.85 
 
 
363 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  31 
 
 
403 aa  154  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  30.81 
 
 
363 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  30.4 
 
 
403 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  30.15 
 
 
429 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2226  putative transposase IS605 family  28.81 
 
 
396 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  27.06 
 
 
380 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  27.53 
 
 
380 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  30.29 
 
 
363 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.4 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  32.43 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5517  putative transposase IS605 family  28.95 
 
 
381 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  27.27 
 
 
376 aa  148  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  28.2 
 
 
369 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  28.2 
 
 
369 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  28.2 
 
 
369 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  28.07 
 
 
370 aa  147  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  28.2 
 
 
369 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  28.2 
 
 
369 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  28.54 
 
 
370 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  28.33 
 
 
370 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  26.56 
 
 
391 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  32.02 
 
 
397 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  32.02 
 
 
397 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  27.83 
 
 
370 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  32 
 
 
422 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  27.83 
 
 
370 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  27.83 
 
 
370 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  27.83 
 
 
393 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  27.83 
 
 
370 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0537  putative transposase IS1341 family  28.24 
 
 
400 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  30.67 
 
 
422 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  27.83 
 
 
393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.16 
 
 
435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3621  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.9 
 
 
406 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  28.23 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.35 
 
 
431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  27.83 
 
 
370 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  33.44 
 
 
399 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>