More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3502 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  95.48 
 
 		 399 aa  728    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  94.47 
 
 		 399 aa  720    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 		 406 aa  811    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  87.19 
 
 		 399 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  86.93 
 
 		 399 aa  688    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  74.37 
 
 		 399 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  74.37 
 
 		 399 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  44.44 
 
 		 361 aa  293  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  43.11 
 
 		 376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  43.99 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  40.82 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  40.46 
 
 		 380 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  40.16 
 
 		 380 aa  246  6.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  39.95 
 
 		 380 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  39.95 
 
 		 380 aa  239  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  39.95 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  39.6 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2680  transposase  69.01 
 
 		 229 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3155  transposase, IS605 OrfB family  40.23 
 
 		 338 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  38.4 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  36.99 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1517  transposase, IS605 OrfB family  38.4 
 
 		 371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1755  transposase, IS605 OrfB family  38.66 
 
 		 371 aa  222  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  36.41 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  38.02 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  35.32 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  34.18 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  35.07 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  35.07 
 
 		 403 aa  203  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  32.39 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.07 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  33.5 
 
 		 411 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  34.1 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  36.97 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1741  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  38.39 
 
 		 354 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  32.9 
 
 		 413 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  34.18 
 
 		 402 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  33.93 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  33.93 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  33.93 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  30.26 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  33.93 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  33.67 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  33.67 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  33.93 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  36.41 
 
 		 397 aa  193  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  36.41 
 
 		 397 aa  193  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.88 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  33.67 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  33.93 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  33.93 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  31.96 
 
 		 449 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  31.99 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  33.16 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2570  transposase, IS605 OrfB family  36.91 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373055  normal  0.271996 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  34.24 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  34.24 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  34.02 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  35.35 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  34.02 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  26.88 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  32.32 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  31.36 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.26 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0873  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  35.18 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  30.33 
 
 		 363 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0778  transposase, IS605 OrfB family  29.04 
 
 		 500 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  30.33 
 
 		 363 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  32.31 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  30.33 
 
 		 363 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  33.33 
 
 		 399 aa  179  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  30.08 
 
 		 363 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  30.08 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  30.08 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  26.82 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  30.33 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  30.08 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  33.33 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  33.33 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  30.83 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  29.82 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  30 
 
 		 363 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  30.03 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1410  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32.25 
 
 		 424 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1366  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32.25 
 
 		 424 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2046  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.75 
 
 		 424 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4522  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32 
 
 		 424 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.839734 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4643  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32.25 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1337  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1600  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32.25 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0840  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32 
 
 		 424 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0586  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32 
 
 		 424 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3183  transposase, IS605 OrfB family  28.24 
 
 		 496 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  33.99 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  37.28 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.08 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  39.54 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  32.92 
 
 		 408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  25.94 
 
 		 370 aa  163  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  31.05 
 
 		 402 aa  163  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>