More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6840 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  92.68 
 
 		 398 aa  697    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 		 396 aa  801    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  73.3 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  70.9 
 
 		 401 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  71.64 
 
 		 403 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  70.65 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  70.43 
 
 		 403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3904  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  75.36 
 
 		 517 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  42.82 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  42.82 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  36.58 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  37.22 
 
 		 422 aa  233  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  43.11 
 
 		 417 aa  232  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  36.48 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  36.48 
 
 		 387 aa  229  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  36.32 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  36.32 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  36.84 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  36.32 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  36.8 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  36.58 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  36.8 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  36.05 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  36.32 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  36.32 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.31 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  37.29 
 
 		 382 aa  222  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  37.29 
 
 		 382 aa  222  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  42.78 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  40.9 
 
 		 416 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  34.95 
 
 		 413 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  35.53 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  33.87 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  33.6 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  40.47 
 
 		 415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  34.38 
 
 		 402 aa  213  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  32.26 
 
 		 411 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  35.36 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  37.95 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  33.93 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  37.69 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  35.2 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.83 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  34.56 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  32.45 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  33.59 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  35.58 
 
 		 348 aa  204  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  34.3 
 
 		 403 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  35.28 
 
 		 348 aa  202  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  35.28 
 
 		 348 aa  202  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  38.36 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  35.43 
 
 		 422 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  37.31 
 
 		 429 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.49 
 
 		 435 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  32.59 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  33.83 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  28.42 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  28.42 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  28.42 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  28.42 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  28.42 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  32.31 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  34.63 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  39.6 
 
 		 219 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  34.11 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  32.03 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  32.03 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  36.44 
 
 		 231 aa  147  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  32.81 
 
 		 398 aa  146  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.32 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  31.22 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.31 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  31.28 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  29.13 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  31.98 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  29.13 
 
 		 367 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0272  transposase  27.54 
 
 		 370 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  30.69 
 
 		 370 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  42.11 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  42.11 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  30.69 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  30.69 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  32.58 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3183  transposase, IS605 OrfB family  29.23 
 
 		 496 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  30.69 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  29.95 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  28.43 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5924  transposase IS605 OrfB  82.02 
 
 		 94 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.81 
 
 		 361 aa  137  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  26.83 
 
 		 383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  30.6 
 
 		 393 aa  136  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0373  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  28.65 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  30.34 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  27.7 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0099  transposase, OrfB family  26.47 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414813  hitchhiker  0.000000000012514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.89 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>