More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3509 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  92.68 
 
 		 396 aa  724    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 		 398 aa  807    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  75.06 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  71.04 
 
 		 401 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  71.78 
 
 		 403 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  70.79 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  71.29 
 
 		 403 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3904  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  75.65 
 
 		 517 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  42.35 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  42.35 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  37.4 
 
 		 402 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  37.6 
 
 		 402 aa  242  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  37.66 
 
 		 402 aa  239  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  37.15 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  37.15 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  37.15 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  37.4 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  37.15 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  37.15 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  37.53 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  37.08 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  43.19 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  37.63 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  37.63 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.56 
 
 		 431 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  36.55 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  37.47 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  36.17 
 
 		 381 aa  226  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  36.17 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  41.88 
 
 		 416 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  34.68 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  35.22 
 
 		 411 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  34.95 
 
 		 413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  40.74 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  34.74 
 
 		 402 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  34.77 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  35.81 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  36.15 
 
 		 403 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  41.44 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  32.8 
 
 		 411 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  33.92 
 
 		 400 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  35.36 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.36 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  32.54 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  35.09 
 
 		 403 aa  205  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  35.69 
 
 		 348 aa  203  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  35.38 
 
 		 348 aa  202  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  35.38 
 
 		 348 aa  202  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  36.43 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  36.02 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  36.43 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  38.96 
 
 		 429 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  36.75 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.02 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  35.4 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  34.13 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  32.49 
 
 		 393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  34.28 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  33.74 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  39.6 
 
 		 219 aa  150  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  31.88 
 
 		 398 aa  149  8e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  31.88 
 
 		 398 aa  149  8e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  32.65 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.32 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  35.98 
 
 		 231 aa  147  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  32.32 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.23 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  31.32 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.59 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  33.59 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5924  transposase IS605 OrfB  77.66 
 
 		 94 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  31.05 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  31.12 
 
 		 361 aa  139  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  30.43 
 
 		 390 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.13 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.87 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  28.87 
 
 		 367 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  31.88 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  31.17 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  28.87 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  30.16 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  30.24 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  30.53 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  34.87 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  30.16 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  26.3 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  26.49 
 
 		 383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  29.18 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  27.55 
 
 		 388 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0272  transposase  27.54 
 
 		 370 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  32.08 
 
 		 405 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>