More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3575 on replicon NC_009470
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009470  Acry_3575  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
468 aa  944    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40765  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2570  transposase, IS605 OrfB family  36.75 
 
 
410 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373055  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  31.65 
 
 
362 aa  176  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  32.38 
 
 
376 aa  163  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  28.91 
 
 
395 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.89 
 
 
361 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  30.17 
 
 
409 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  28.76 
 
 
363 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  28.76 
 
 
363 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  29.03 
 
 
363 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  29.03 
 
 
363 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  28.76 
 
 
363 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  28.76 
 
 
363 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  28.76 
 
 
363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  28.76 
 
 
363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  28.76 
 
 
363 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  28.23 
 
 
363 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  30.81 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  28.21 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  31.11 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  31.11 
 
 
380 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  31.02 
 
 
380 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  26.52 
 
 
449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  28.57 
 
 
370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  24.81 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  30.42 
 
 
380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2680  transposase, IS605 OrfB family  28.68 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  30.18 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  30.13 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  29.13 
 
 
373 aa  130  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2509  transposase, IS605 OrfB family  33.1 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1726  ISHa1675 transposase B  26.13 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.773087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1517  transposase, IS605 OrfB family  30.21 
 
 
371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0256  ISHa1675 transposase B  26.13 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2571  transposase, IS605 OrfB family  37.5 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1254  ISHa1675 transposase B  26.13 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0163601  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3012  transposase, IS605 OrfB family  27.32 
 
 
395 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  30.43 
 
 
466 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1755  transposase, IS605 OrfB family  30.21 
 
 
371 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  27.27 
 
 
403 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  27.27 
 
 
403 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  27.27 
 
 
403 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  27.27 
 
 
403 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  27.27 
 
 
403 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0812  transposase, IS605 OrfB family  33.47 
 
 
418 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  31.75 
 
 
399 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3927  transposase, IS605 OrfB family  31.01 
 
 
409 aa  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.770218  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2314  transposase, IS605 OrfB family  28.53 
 
 
419 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  30.23 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  31.27 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2202  transposase, IS605 OrfB family  27.78 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  25.73 
 
 
440 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  29.62 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  30.29 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  31.75 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.97 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  29.97 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3397  transposase, IS605 OrfB family  33.19 
 
 
407 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  31.76 
 
 
405 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  26.91 
 
 
405 aa  118  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2840  transposase, IS605 OrfB family  36.21 
 
 
413 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249005  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3051  transposase, IS605 OrfB family  27.79 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3190  transposase, IS605 OrfB family  33.89 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  29.97 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  22.65 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  31.67 
 
 
399 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  30.32 
 
 
368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3945  transposase, IS605 OrfB family  34.69 
 
 
413 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0386  IS605 family transposase OrfB  27.44 
 
 
394 aa  113  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  30.77 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0272  transposase  25.97 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0401  transposase  28.76 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.23 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  25.4 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  30.77 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  29.52 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0873  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  26.99 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3994  transposase, IS605 OrfB family  31.48 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.437884  normal  0.653956 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  31.49 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  31.49 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2858  transposase, IS605 OrfB family  34.65 
 
 
376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.551858  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2909  transposase, IS605 OrfB family  31.48 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  31.49 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  31.49 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  28.08 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  31.49 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0067  IS605 family transposase OrfB  26.36 
 
 
370 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  36.28 
 
 
442 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  27.44 
 
 
390 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0099  transposase, OrfB family  26.36 
 
 
370 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414813  hitchhiker  0.000000000012514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  29.18 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  32.13 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  25 
 
 
383 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2226  putative transposase IS605 family  26.94 
 
 
396 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4125  transposase  28.41 
 
 
264 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0035841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  25.74 
 
 
383 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0055  transposase IS605 OrfB  31.54 
 
 
303 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  25 
 
 
383 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.39 
 
 
399 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  25 
 
 
383 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>