More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3275 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3275  transposase  100 
 
 		 405 aa  835    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  43.8 
 
 		 442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  42.01 
 
 		 461 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  43.4 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  43.4 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  37.64 
 
 		 420 aa  242  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  43.94 
 
 		 356 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  43.6 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  37.17 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12899  transposase  36.1 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0267522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  52.53 
 
 		 261 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12993  transposase  35.37 
 
 		 459 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000929698  normal  0.662784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12804  transposase  34.47 
 
 		 459 aa  190  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00653678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  38.05 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  38.05 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5487  IS605 family transposase OrfB  40.29 
 
 		 293 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643829  normal  0.289527 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  34.33 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  35.28 
 
 		 383 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  60 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.59 
 
 		 391 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  37.12 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  37.12 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  34.57 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  34.57 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13861  transposase  34.28 
 
 		 407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  40.97 
 
 		 409 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  34.86 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10940  transposase  33.49 
 
 		 550 aa  159  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  46.74 
 
 		 363 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0401  transposase  39.6 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  45.95 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  34.33 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.76 
 
 		 376 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  40.48 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  41.98 
 
 		 267 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  30.6 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  36.28 
 
 		 403 aa  150  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.93 
 
 		 381 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0120  family transposase, OrfB  30.97 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180959 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0093  family transposase, OrfB  30.97 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  32 
 
 		 373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  28.2 
 
 		 326 aa  146  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  38.31 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  31.23 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  31.23 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  31.23 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  31.23 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  31.23 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  30.14 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  35.17 
 
 		 377 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  32.44 
 
 		 410 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  39.62 
 
 		 405 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  31.53 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  33.13 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  38.32 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  27.58 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  34.83 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2297  transposase IS605 OrfB  65.59 
 
 		 192 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294637  normal  0.708384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  31.83 
 
 		 383 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3084  IS605 family transposase OrfB  29.01 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  29.09 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  31.83 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  40.98 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  28.23 
 
 		 440 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  31.35 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  31.35 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  39.81 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  37.5 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  31.35 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  31.35 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  30.65 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  29.15 
 
 		 304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0641  IS605 family transposase OrfB  35.56 
 
 		 384 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133268  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  36.92 
 
 		 391 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1851  IS605 family transposase OrfB  35.56 
 
 		 384 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  39.72 
 
 		 403 aa  136  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.31 
 
 		 381 aa  136  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  28.95 
 
 		 383 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  29.78 
 
 		 387 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  29.05 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  29.05 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  29.05 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  26.97 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  29.05 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  29.05 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  28.88 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  40.09 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0468  IS605 family transposase OrfB  33.78 
 
 		 299 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  26.23 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  28.97 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  28.65 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  33.03 
 
 		 381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3922  IS605 family transposase OrfB  28.49 
 
 		 394 aa  133  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  33.44 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.93 
 
 		 381 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  42.13 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1991  transposase  31.82 
 
 		 383 aa  133  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166547  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  28.57 
 
 		 373 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  26.46 
 
 		 370 aa  132  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0746  ISCpe4, transposase  36.04 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>