More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2681 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2681  transposase  100 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  98.47 
 
 		 442 aa  518  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  83.67 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  83.67 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  77.01 
 
 		 356 aa  400  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  76.63 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  76.73 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  97.38 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  67.73 
 
 		 267 aa  322  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  53.71 
 
 		 420 aa  263  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2297  transposase IS605 OrfB  82.03 
 
 		 192 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294637  normal  0.708384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2200  transposase IS605 OrfB  78.95 
 
 		 134 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  44.3 
 
 		 393 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  44.3 
 
 		 393 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  45.85 
 
 		 409 aa  205  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  52.53 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  47.69 
 
 		 399 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  52.15 
 
 		 410 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  47.24 
 
 		 440 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  46.3 
 
 		 363 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  49.08 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  43.12 
 
 		 393 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  45.65 
 
 		 399 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  45.65 
 
 		 399 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  47.57 
 
 		 368 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  47.62 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  48.64 
 
 		 398 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  48.64 
 
 		 398 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  48.29 
 
 		 406 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  49.04 
 
 		 405 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  48.18 
 
 		 398 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  44.17 
 
 		 395 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  46.89 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  41.48 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  44.4 
 
 		 292 aa  175  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  42.19 
 
 		 390 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  45.13 
 
 		 424 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1968  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  59.24 
 
 		 197 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.304604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  46.98 
 
 		 381 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  44.94 
 
 		 410 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  48.37 
 
 		 376 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  40.95 
 
 		 393 aa  168  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  39.17 
 
 		 384 aa  168  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  41.85 
 
 		 391 aa  168  9e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  38.53 
 
 		 384 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  39.17 
 
 		 384 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  39.17 
 
 		 384 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  38.68 
 
 		 383 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  38.71 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  39.17 
 
 		 384 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  39.17 
 
 		 384 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  46.92 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  41.1 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  38.68 
 
 		 384 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  39.17 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  38.53 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  38.71 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  38.71 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  42.23 
 
 		 370 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  38.71 
 
 		 384 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  37.9 
 
 		 403 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  38.28 
 
 		 405 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  36.06 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  36.84 
 
 		 373 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  36.78 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  36.78 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  36.78 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  36.78 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1049  ISCpe2, transposase orfB  38.25 
 
 		 384 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00154487  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  40.29 
 
 		 391 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  36.97 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  36.97 
 
 		 393 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  48.11 
 
 		 377 aa  161  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  38.46 
 
 		 381 aa  161  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  38.25 
 
 		 384 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  36.89 
 
 		 403 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  36.36 
 
 		 373 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  36.02 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  36.49 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  36.02 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  37.2 
 
 		 372 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5487  IS605 family transposase OrfB  45.3 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643829  normal  0.289527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  40.27 
 
 		 381 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  36.84 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0401  transposase  41.71 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  40.29 
 
 		 370 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  36.36 
 
 		 372 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  37.2 
 
 		 372 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  36.02 
 
 		 370 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  34.13 
 
 		 370 aa  158  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  36.49 
 
 		 370 aa  158  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  39.36 
 
 		 417 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  39.32 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  42.03 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  36.71 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  33.65 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  41.35 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  41.05 
 
 		 384 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.6 
 
 		 372 aa  156  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  46.93 
 
 		 377 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>