More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2858 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013502  Rmar_2858  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
376 aa  775    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.551858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2486  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  49.73 
 
 
380 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0022  IS891/IS1136/IS1341 transposase  48.27 
 
 
374 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  37.34 
 
 
385 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  35.54 
 
 
383 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  35.26 
 
 
371 aa  219  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  35.71 
 
 
383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  36.8 
 
 
383 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  35.44 
 
 
383 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  34.46 
 
 
385 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  34.23 
 
 
383 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  34.23 
 
 
383 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  34.23 
 
 
383 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  34.23 
 
 
383 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  33.78 
 
 
370 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  34.04 
 
 
370 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  36.36 
 
 
369 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  36.36 
 
 
369 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  36.36 
 
 
369 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  36.36 
 
 
369 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  36.36 
 
 
369 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  34.05 
 
 
383 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  35.32 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  33.33 
 
 
373 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  34.72 
 
 
370 aa  199  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  34.72 
 
 
370 aa  199  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  34.72 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  32.6 
 
 
373 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  34.72 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  34.82 
 
 
370 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  32.52 
 
 
373 aa  195  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  34.72 
 
 
393 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  34.82 
 
 
370 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  34.72 
 
 
370 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  36.48 
 
 
399 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  36.48 
 
 
399 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  34.44 
 
 
393 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  36.27 
 
 
380 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  32.25 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  31.71 
 
 
372 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  31.98 
 
 
372 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  31.71 
 
 
372 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  36.88 
 
 
311 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  33.06 
 
 
394 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  34.17 
 
 
370 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  33.89 
 
 
370 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  33.06 
 
 
394 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  31.98 
 
 
373 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  32.25 
 
 
373 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  31.98 
 
 
373 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.73 
 
 
391 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  31.98 
 
 
373 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  31.54 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.04 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  30.95 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  35.22 
 
 
380 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
402 aa  182  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  32.66 
 
 
405 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  33.42 
 
 
425 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  33.07 
 
 
424 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  33.59 
 
 
402 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  33.59 
 
 
402 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  33.52 
 
 
405 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  33.52 
 
 
405 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  29.69 
 
 
402 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  34.76 
 
 
383 aa  179  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  34.7 
 
 
393 aa  179  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  34.16 
 
 
450 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  32.35 
 
 
399 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  31.62 
 
 
403 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  31.62 
 
 
403 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  31.62 
 
 
403 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  31.62 
 
 
403 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  31.62 
 
 
403 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  34.16 
 
 
392 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  32.27 
 
 
396 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  31.31 
 
 
440 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  34.52 
 
 
392 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  35.62 
 
 
304 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  32.69 
 
 
394 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  31.86 
 
 
403 aa  176  6e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  29.89 
 
 
383 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.75 
 
 
372 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.19 
 
 
402 aa  176  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  37.72 
 
 
300 aa  176  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  31.66 
 
 
382 aa  175  9e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  30.89 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1540  IS605 family transposase OrfB  45.18 
 
 
223 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  30.59 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  30.87 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0100  IS891/IS1136/IS1341 transposase  30.91 
 
 
401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  31.05 
 
 
378 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  33.06 
 
 
392 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  33.86 
 
 
409 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  32.51 
 
 
427 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  32.51 
 
 
390 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  32.34 
 
 
368 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  31.04 
 
 
404 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  31.04 
 
 
404 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  28.8 
 
 
383 aa  169  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>