221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5924 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5924  transposase IS605 OrfB  100 
 
 		 94 aa  186  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  90.43 
 
 		 403 aa  172  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  90.43 
 
 		 403 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  89.36 
 
 		 401 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  89.36 
 
 		 403 aa  169  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  77.66 
 
 		 398 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  82.02 
 
 		 396 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3904  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  83.54 
 
 		 517 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  67.03 
 
 		 396 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  57.47 
 
 		 397 aa  88.6  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  57.47 
 
 		 397 aa  88.6  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  72.58 
 
 		 416 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  58.23 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  58.23 
 
 		 402 aa  80.5  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  56.96 
 
 		 402 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  56.96 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  56.96 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  56.96 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  56.96 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  56.96 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  56.96 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  56.96 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  59.72 
 
 		 387 aa  77.4  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  66.13 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  55.7 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  55.7 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  55.7 
 
 		 402 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  50.63 
 
 		 402 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  56.72 
 
 		 422 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  68.25 
 
 		 417 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  62.75 
 
 		 399 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  65.31 
 
 		 399 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  65.31 
 
 		 399 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2830  transposase IS200-family protein  50.65 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  62.71 
 
 		 429 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0877  IS605 family transposase OrfB  56.6 
 
 		 372 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000122455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  66 
 
 		 386 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2532  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  48.1 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4127  transposase IS605 OrfB  59.18 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  48.19 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0216  hypothetical protein  49.09 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4167  transposase IS605 OrfB  57.14 
 
 		 494 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.220651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  48.65 
 
 		 435 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  60.34 
 
 		 385 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  52.94 
 
 		 348 aa  63.9  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  52.94 
 
 		 348 aa  63.9  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  61.82 
 
 		 408 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0136  transposase, IS605 OrfB family  40.51 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  61.82 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  58.33 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1833  IS605 family transposase OrfB  61.22 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  61.22 
 
 		 399 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  58.33 
 
 		 381 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2881  transposase, IS605 OrfB family  53.85 
 
 		 388 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  50.98 
 
 		 348 aa  62  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1197  transposase, IS605 OrfB family  42.19 
 
 		 405 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6879  IS605 family transposase OrfB  55.74 
 
 		 387 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  58.49 
 
 		 429 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  42.17 
 
 		 411 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  58.7 
 
 		 411 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  58.7 
 
 		 411 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  60.87 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  58.7 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  54.55 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  52.73 
 
 		 399 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  59.18 
 
 		 399 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3626  transposase, IS605 OrfB family  55.77 
 
 		 425 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  42.17 
 
 		 413 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  56.52 
 
 		 411 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  45.21 
 
 		 422 aa  57.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2488  transposase, IS605 OrfB family  53.23 
 
 		 439 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0681  transposase, IS605 OrfB family  53.23 
 
 		 427 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146428  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  57.14 
 
 		 399 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5480  IS605 family transposase OrfB  56.86 
 
 		 419 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.92096 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3539  transposase, IS605 OrfB family  46.48 
 
 		 375 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.3879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0563  transposase, IS605 OrfB family  46.48 
 
 		 375 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.11437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2779  transposase, IS605 OrfB family  52.46 
 
 		 412 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  47.37 
 
 		 219 aa  57  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2741  transposase, IS605 OrfB  56.25 
 
 		 518 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230719  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2016  transposase  46.43 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0680  transposase, IS605 OrfB  56.25 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3330  Transport-associated OB domain protein  53.85 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1086  transposase, IS605 OrfB family  52 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1034  transposon transposase  54.35 
 
 		 501 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.520608  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0996  transposase, IS605 OrfB family  45.71 
 
 		 409 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0800  transposase  44.64 
 
 		 373 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  51.06 
 
 		 403 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  48.08 
 
 		 406 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1189  transposase, IS605 OrfB family  52.94 
 
 		 382 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  51.06 
 
 		 403 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0135  transposase, putative  45 
 
 		 409 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0133  transposase  45 
 
 		 409 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2506  transposase  39.68 
 
 		 427 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000109626  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0712  transposase, IS605 OrfB family  46.81 
 
 		 506 aa  53.9  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0526534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1123  transposase, IS605 OrfB family  46.81 
 
 		 395 aa  53.9  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.144055  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  48.94 
 
 		 403 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1199  transposase IS605  45.07 
 
 		 410 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0968514  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  50 
 
 		 231 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2621  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 		 412 aa  52.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2561  transposase, IS605 OrfB family  44.29 
 
 		 440 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>