251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1034 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1034  transposon transposase  100 
 
 		 501 aa  1038    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.520608  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0712  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 		 506 aa  280  6e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0526534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1123  transposase, IS605 OrfB family  36.41 
 
 		 395 aa  250  4e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.144055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  25.35 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  25.35 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32.23 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  29.21 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  29.21 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  28.3 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2350  IS605 family transposase OrfB  28.64 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  29.22 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  29.81 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  30.5 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0135  transposase, putative  28.25 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0133  transposase  28.25 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  30.89 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  29 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0216  hypothetical protein  38.67 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  27.67 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  30 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  30 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  29 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  30.57 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  29 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  29 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  30.73 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  29 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  28.17 
 
 		 399 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  30.89 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  27.18 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  28.28 
 
 		 411 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  29 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  30 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  28.32 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  28.64 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.8 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  29.8 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  27.36 
 
 		 422 aa  62  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0534  transposase, IS605 OrfB family  27.69 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.268314  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.29 
 
 		 398 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.41 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.61 
 
 		 396 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  29.59 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  27.7 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0996  transposase, IS605 OrfB family  26.98 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0745  transposase IS605 OrfB  32.21 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00432126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0271  transposase IS605 OrfB  32.21 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000409425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  28.43 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1161  transposase, IS605 OrfB family  26.34 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1117  transposase IS605 OrfB  32.21 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000234491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1833  IS605 family transposase OrfB  27.18 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  27.13 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  27.94 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0541  transposase, IS605 OrfB family  27.96 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  29.29 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  26.63 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.18 
 
 		 401 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  29.44 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1931  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  29.29 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3581  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  29.74 
 
 		 444 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1958  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  29.29 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0714326  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  21.58 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  21.58 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  50 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.92 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  41.1 
 
 		 406 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0136  transposase, IS605 OrfB family  27.5 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  21.26 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  41.1 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3904  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.92 
 
 		 517 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  41.1 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5924  transposase IS605 OrfB  54.35 
 
 		 94 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0373  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  29.74 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4205  transposase, IS605 OrfB family  25.93 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  25.77 
 
 		 361 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2211  transposase IS605  29.19 
 
 		 371 aa  54.7  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.95 
 
 		 403 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2065  transposase, IS1341 family  25.61 
 
 		 392 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0120  family transposase, OrfB  24.61 
 
 		 372 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180959 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2881  transposase, IS605 OrfB family  24.71 
 
 		 388 aa  54.3  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0093  family transposase, OrfB  24.61 
 
 		 372 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  28.79 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  28.79 
 
 		 442 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  22.8 
 
 		 348 aa  53.5  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2532  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  41.79 
 
 		 103 aa  53.5  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  44.07 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4128  transposase, IS605 OrfB family  23.65 
 
 		 397 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.431566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  39.74 
 
 		 429 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0928  transposase, IS605 OrfB  26.57 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.621318  normal  0.596351 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  24.05 
 
 		 402 aa  53.5  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  24.05 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  27.18 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.89 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  24.05 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0386  IS605 family transposase OrfB  27.27 
 
 		 394 aa  53.5  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0800  transposase  26.94 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0436  transposase, IS605 OrfB family  26.67 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.178599  normal  0.292397 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5480  IS605 family transposase OrfB  44.64 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.92096 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  27.73 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0426  transposase, IS605 OrfB family  26.67 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.164163  normal  0.210825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>