More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2211 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2211  transposase IS605  100 
 
 		 371 aa  761    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1833  IS605 family transposase OrfB  38.03 
 
 		 368 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1851  transposase, IS605 OrfB family  36.06 
 
 		 360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000015791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3136  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1921  transposase, IS605 OrfB family  36.06 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0530  transposase, IS605 OrfB family  36.06 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0284  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000238986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2867  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0234  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0585  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1167  transposase, IS605 OrfB family  36.06 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000668854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1577  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0208104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1446  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.252161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2358  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0658803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1854  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00011315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2682  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0586461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0162  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0171  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2261  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2274  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.118023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2654  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00128227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0615  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.562099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0632  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000767619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2228  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00238783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1753  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1586  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000279316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2095  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1768  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1257  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2240  transposase, IS605 OrfB family  35.49 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000297406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0456  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1604  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2198  transposase IS605  34.37 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2125  transposase, IS605 OrfB family  36.8 
 
 		 370 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00617237  decreased coverage  0.0000396034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1116  transposase, IS605 OrfB family  37.04 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.355527 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1200  transposase, IS605 OrfB family  37.04 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0919979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2686  transposase  37.46 
 
 		 372 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.442816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  34.45 
 
 		 385 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6879  IS605 family transposase OrfB  36.86 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2881  transposase, IS605 OrfB family  33.05 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2493  transposase, IS605 OrfB family  32.07 
 
 		 401 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2854  transposase, IS605 OrfB family  36.41 
 
 		 403 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0800  transposase  31.47 
 
 		 373 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2941  transposase, IS605 OrfB family  31.79 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0541  transposase, IS605 OrfB family  33.43 
 
 		 372 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2016  transposase  30.48 
 
 		 372 aa  167  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0563  transposase, IS605 OrfB family  34.94 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.11437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1399  transposase, IS605 OrfB family  32.21 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3539  transposase, IS605 OrfB family  34.94 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.3879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1692  transposase  37.02 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153302  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7429  transposase  37.47 
 
 		 358 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1189  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1199  transposase IS605  34.72 
 
 		 410 aa  159  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0968514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1779  transposase, IS605 OrfB family  34.34 
 
 		 372 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4128  transposase, IS605 OrfB family  31.72 
 
 		 397 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.431566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0681  transposase, IS605 OrfB family  32.7 
 
 		 427 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146428  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2488  transposase, IS605 OrfB family  32.7 
 
 		 439 aa  156  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3330  Transport-associated OB domain protein  33.05 
 
 		 418 aa  156  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0563  transposase, IS605 OrfB family  30.87 
 
 		 372 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4063  transposase, IS1341 family  32.61 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1250  transposase, IS605 OrfB family  30.87 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2902  transposase  31.4 
 
 		 407 aa  153  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00617488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4652  transposase, IS1341 family  32.07 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000354278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2779  transposase, IS605 OrfB family  31.4 
 
 		 412 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1161  transposase, IS605 OrfB family  30.92 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2561  transposase, IS605 OrfB family  31.15 
 
 		 440 aa  149  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4043  transposase, OrfB family  31.38 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1366  transposase IS605 OrfB domain-containing protein  30.85 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2065  transposase, IS1341 family  30.06 
 
 		 392 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2621  transposase, IS605 OrfB family  29.76 
 
 		 412 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0861  transposase, IS1341 family  28.65 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2903  IS605 family transposase OrfB  30.59 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0029358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1982  transposase, IS605 OrfB family  37.65 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2374  transposase, IS605 OrfB family  37.25 
 
 		 351 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3626  transposase, IS605 OrfB family  32.43 
 
 		 425 aa  143  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3375  transposase, IS605 OrfB family  30.05 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2549  transposase, IS605 OrfB family  36.84 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2685  transposase, IS605 OrfB family  36.44 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3343  transposase, IS605 OrfB family  36.84 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2840  transposase, IS605 OrfB family  37.25 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3030  transposase, IS605 OrfB family  32.18 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0996  transposase, IS605 OrfB family  29.95 
 
 		 409 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2741  transposase, IS605 OrfB  32.32 
 
 		 518 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230719  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0680  transposase, IS605 OrfB  31.17 
 
 		 414 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5354  transposase, family IS1341  30.65 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5275  transposase, family IS1341  30.65 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0827371 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2346  transposase, IS605 OrfB family  28.8 
 
 		 401 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0877  IS605 family transposase OrfB  30.38 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000122455  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5480  IS605 family transposase OrfB  29.83 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.92096 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0928  transposase, IS605 OrfB  30.75 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.621318  normal  0.596351 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4205  transposase, IS605 OrfB family  29.26 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1086  transposase, IS605 OrfB family  27.41 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1635  transposase, IS605 OrfB family  34.41 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0136  transposase, IS605 OrfB family  27.53 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2491  transposase, IS605 OrfB family  35.07 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0534  transposase, IS605 OrfB family  28.07 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.268314  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3043  IS605 family transposase OrfB  30.49 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3159  transposase, IS605 OrfB family  30.55 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0569  transposase, IS605 OrfB family  34.59 
 
 		 424 aa  115  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.853374 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3391  transposase, IS605 OrfB family  25.79 
 
 		 415 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>