More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1833 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1833  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
368 aa  769    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2198  transposase IS605  72.01 
 
 
368 aa  548  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2125  transposase, IS605 OrfB family  50.14 
 
 
370 aa  342  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00617237  decreased coverage  0.0000396034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1167  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000668854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1257  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2095  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0234  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1768  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1586  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000279316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1921  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2261  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0456  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0284  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000238986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0530  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0632  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000767619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1854  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00011315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2682  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0586461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2654  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00128227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0171  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0615  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.562099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2274  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.118023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2358  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0658803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1577  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0208104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2228  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00238783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1604  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0162  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1446  transposase, IS605 OrfB family  46.86 
 
 
360 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.252161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1753  transposase, IS605 OrfB family  46.57 
 
 
360 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2867  transposase, IS605 OrfB family  46.57 
 
 
360 aa  285  7e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2240  transposase, IS605 OrfB family  46.57 
 
 
360 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000297406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0585  transposase, IS605 OrfB family  46.57 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1851  transposase, IS605 OrfB family  46.57 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000015791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6879  IS605 family transposase OrfB  47.97 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3136  transposase, IS605 OrfB family  46.29 
 
 
360 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2686  transposase  46.18 
 
 
372 aa  276  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.442816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  43.24 
 
 
385 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1116  transposase, IS605 OrfB family  44.41 
 
 
374 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.355527 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1200  transposase, IS605 OrfB family  44.41 
 
 
374 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0919979  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1692  transposase  46.57 
 
 
358 aa  255  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153302  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0563  transposase, IS605 OrfB family  42.63 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.11437 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3539  transposase, IS605 OrfB family  42.63 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.3879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7429  transposase  45.89 
 
 
358 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2881  transposase, IS605 OrfB family  41.11 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1779  transposase, IS605 OrfB family  41.46 
 
 
372 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5480  IS605 family transposase OrfB  39.66 
 
 
419 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.92096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2854  transposase, IS605 OrfB family  40.49 
 
 
403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2211  transposase IS605  38.03 
 
 
371 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3330  Transport-associated OB domain protein  37.57 
 
 
418 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133521  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0681  transposase, IS605 OrfB family  36.16 
 
 
427 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146428  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2779  transposase, IS605 OrfB family  36.71 
 
 
412 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306797  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2488  transposase, IS605 OrfB family  36.16 
 
 
439 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3626  transposase, IS605 OrfB family  36.21 
 
 
425 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2016  transposase  35.6 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1199  transposase IS605  35.09 
 
 
410 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0968514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2493  transposase, IS605 OrfB family  37.65 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2941  transposase, IS605 OrfB family  37.35 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0800  transposase  33.6 
 
 
373 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1399  transposase, IS605 OrfB family  37.31 
 
 
375 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4063  transposase, IS1341 family  34.35 
 
 
400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1189  transposase, IS605 OrfB family  35.12 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2902  transposase  33.33 
 
 
407 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00617488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4652  transposase, IS1341 family  33.52 
 
 
400 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000354278 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0996  transposase, IS605 OrfB family  33.61 
 
 
409 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0928  transposase, IS605 OrfB  32.32 
 
 
450 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.621318  normal  0.596351 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3043  IS605 family transposase OrfB  32.32 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0541  transposase, IS605 OrfB family  31.23 
 
 
372 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2561  transposase, IS605 OrfB family  32.14 
 
 
440 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1250  transposase, IS605 OrfB family  31.97 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2065  transposase, IS1341 family  32.03 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1161  transposase, IS605 OrfB family  30.87 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0534  transposase, IS605 OrfB family  32.24 
 
 
409 aa  139  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.268314  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0135  transposase, putative  29.9 
 
 
409 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0133  transposase  29.9 
 
 
409 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0563  transposase, IS605 OrfB family  31.69 
 
 
372 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0877  IS605 family transposase OrfB  30.92 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000122455  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5275  transposase, family IS1341  32.14 
 
 
463 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0827371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2685  transposase, IS605 OrfB family  39.27 
 
 
351 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5354  transposase, family IS1341  32.14 
 
 
442 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2549  transposase, IS605 OrfB family  39.68 
 
 
400 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2346  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
401 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0861  transposase, IS1341 family  31.06 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4205  transposase, IS605 OrfB family  35.34 
 
 
417 aa  132  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1982  transposase, IS605 OrfB family  39.27 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4043  transposase, OrfB family  29.59 
 
 
371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0136  transposase, IS605 OrfB family  29.06 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2374  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 
351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1366  transposase IS605 OrfB domain-containing protein  29.32 
 
 
371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3343  transposase, IS605 OrfB family  38.87 
 
 
351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2903  IS605 family transposase OrfB  29.32 
 
 
371 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0029358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2840  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 
351 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4128  transposase, IS605 OrfB family  29.83 
 
 
397 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.431566  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3030  transposase, IS605 OrfB family  30.19 
 
 
396 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3375  transposase, IS605 OrfB family  28.88 
 
 
412 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2621  transposase, IS605 OrfB family  29.7 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1635  transposase, IS605 OrfB family  36.99 
 
 
351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3391  transposase, IS605 OrfB family  28.12 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1086  transposase, IS605 OrfB family  28.35 
 
 
434 aa  117  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2506  transposase  27.14 
 
 
427 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000109626  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3159  transposase, IS605 OrfB family  30.03 
 
 
430 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2741  transposase, IS605 OrfB  33.19 
 
 
518 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>