More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1189 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1189  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
382 aa  759    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2779  transposase, IS605 OrfB family  65.85 
 
 
412 aa  463  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306797  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3626  transposase, IS605 OrfB family  62.4 
 
 
425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3330  Transport-associated OB domain protein  63.83 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133521  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2488  transposase, IS605 OrfB family  61.36 
 
 
439 aa  438  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0681  transposase, IS605 OrfB family  61.36 
 
 
427 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146428  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3539  transposase, IS605 OrfB family  45.2 
 
 
375 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.3879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0563  transposase, IS605 OrfB family  45.2 
 
 
375 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.11437 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2861  transposase  92.21 
 
 
178 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1200  transposase, IS605 OrfB family  43.31 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0919979  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1116  transposase, IS605 OrfB family  43.31 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.355527 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2881  transposase, IS605 OrfB family  39.15 
 
 
388 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1604  transposase, IS605 OrfB family  41.94 
 
 
360 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2867  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0585  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0284  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000238986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1921  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0234  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2682  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0586461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2654  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00128227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2274  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.118023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2358  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0658803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1577  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0208104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0632  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000767619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1446  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.252161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0162  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0615  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.562099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0530  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1854  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00011315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0171  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2228  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00238783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1257  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1768  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1851  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000015791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1586  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000279316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2095  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1167  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 
360 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000668854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1753  transposase, IS605 OrfB family  41.39 
 
 
360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2240  transposase, IS605 OrfB family  41.39 
 
 
360 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000297406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2261  transposase, IS605 OrfB family  41.39 
 
 
360 aa  216  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3136  transposase, IS605 OrfB family  41.39 
 
 
360 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0456  transposase, IS605 OrfB family  41.39 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2493  transposase, IS605 OrfB family  35.1 
 
 
401 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2941  transposase, IS605 OrfB family  34.82 
 
 
401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4063  transposase, IS1341 family  35.46 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1399  transposase, IS605 OrfB family  33.68 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0861  transposase, IS1341 family  34.25 
 
 
404 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4652  transposase, IS1341 family  35.18 
 
 
400 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000354278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2065  transposase, IS1341 family  34.46 
 
 
392 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2686  transposase  36.47 
 
 
372 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.442816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2125  transposase, IS605 OrfB family  39.55 
 
 
370 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00617237  decreased coverage  0.0000396034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2198  transposase IS605  36.17 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1833  IS605 family transposase OrfB  35.39 
 
 
368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7429  transposase  38.57 
 
 
358 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2211  transposase IS605  33.95 
 
 
371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0563  transposase, IS605 OrfB family  31.97 
 
 
372 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1366  transposase IS605 OrfB domain-containing protein  28.34 
 
 
371 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1161  transposase, IS605 OrfB family  32.82 
 
 
372 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2903  IS605 family transposase OrfB  28.34 
 
 
371 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0029358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0928  transposase, IS605 OrfB  31.85 
 
 
450 aa  160  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.621318  normal  0.596351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4043  transposase, OrfB family  28.34 
 
 
371 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1250  transposase, IS605 OrfB family  31.88 
 
 
372 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0541  transposase, IS605 OrfB family  32.55 
 
 
372 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3043  IS605 family transposase OrfB  32.09 
 
 
450 aa  157  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2016  transposase  31.12 
 
 
372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  34.66 
 
 
385 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1199  transposase IS605  35.18 
 
 
410 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0968514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2902  transposase  32.36 
 
 
407 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00617488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1692  transposase  38.63 
 
 
358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153302  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6879  IS605 family transposase OrfB  36.34 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0133  transposase  30.75 
 
 
409 aa  145  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0135  transposase, putative  30.75 
 
 
409 aa  145  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0800  transposase  31.55 
 
 
373 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2549  transposase, IS605 OrfB family  29.2 
 
 
400 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2374  transposase, IS605 OrfB family  29.97 
 
 
351 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3343  transposase, IS605 OrfB family  29.97 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2840  transposase, IS605 OrfB family  30.25 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1982  transposase, IS605 OrfB family  29.97 
 
 
351 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5275  transposase, family IS1341  27.71 
 
 
463 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0827371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2685  transposase, IS605 OrfB family  30.25 
 
 
351 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5354  transposase, family IS1341  27.71 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1635  transposase, IS605 OrfB family  29.78 
 
 
351 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1779  transposase, IS605 OrfB family  31.68 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2506  transposase  29.07 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000109626  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2561  transposase, IS605 OrfB family  29.87 
 
 
440 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467488  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4128  transposase, IS605 OrfB family  30.73 
 
 
397 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.431566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0877  IS605 family transposase OrfB  29.44 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000122455  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1086  transposase, IS605 OrfB family  28.93 
 
 
434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2346  transposase, IS605 OrfB family  30.27 
 
 
401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2854  transposase, IS605 OrfB family  31.4 
 
 
403 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0996  transposase, IS605 OrfB family  28.85 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4205  transposase, IS605 OrfB family  28.99 
 
 
417 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3391  transposase, IS605 OrfB family  26.97 
 
 
415 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3375  transposase, IS605 OrfB family  28.19 
 
 
412 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2621  transposase, IS605 OrfB family  28.33 
 
 
412 aa  113  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0534  transposase, IS605 OrfB family  28.76 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.268314  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5480  IS605 family transposase OrfB  31.87 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.92096 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4668  transposase  26.72 
 
 
359 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3159  transposase, IS605 OrfB family  27.33 
 
 
430 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0882  transposase  25.62 
 
 
359 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00721916  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>