More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3043 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3043  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
450 aa  931    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0928  transposase, IS605 OrfB  97.33 
 
 
450 aa  910    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.621318  normal  0.596351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5354  transposase, family IS1341  55.7 
 
 
442 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5275  transposase, family IS1341  55.7 
 
 
463 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0827371 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0133  transposase  38.52 
 
 
409 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0135  transposase, putative  38.52 
 
 
409 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2506  transposase  34.92 
 
 
427 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000109626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0563  transposase, IS605 OrfB family  35.31 
 
 
372 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1250  transposase, IS605 OrfB family  35.05 
 
 
372 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1161  transposase, IS605 OrfB family  35.77 
 
 
372 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0541  transposase, IS605 OrfB family  34.76 
 
 
372 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4043  transposase, OrfB family  34.1 
 
 
371 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1199  transposase IS605  35.9 
 
 
410 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0968514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1366  transposase IS605 OrfB domain-containing protein  33.59 
 
 
371 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2903  IS605 family transposase OrfB  33.59 
 
 
371 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0029358  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2902  transposase  36.45 
 
 
407 aa  190  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00617488  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2881  transposase, IS605 OrfB family  32.91 
 
 
388 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0234  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2867  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0284  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000238986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2240  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
360 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000297406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0585  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1753  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1768  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1446  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.252161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2274  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.118023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2358  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0658803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0162  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2654  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00128227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2682  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0586461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1854  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00011315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2095  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0615  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.562099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1257  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0632  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000767619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1586  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000279316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2228  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00238783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1577  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0208104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0171  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1921  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0800  transposase  31.28 
 
 
373 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1167  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000668854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0530  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3330  Transport-associated OB domain protein  33.5 
 
 
418 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133521  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1604  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1851  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000015791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0456  transposase, IS605 OrfB family  33.07 
 
 
360 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3136  transposase, IS605 OrfB family  32.81 
 
 
360 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  33.83 
 
 
385 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2261  transposase, IS605 OrfB family  32.81 
 
 
360 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1189  transposase, IS605 OrfB family  32.09 
 
 
382 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2016  transposase  29.87 
 
 
372 aa  149  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1833  IS605 family transposase OrfB  32.32 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2779  transposase, IS605 OrfB family  32.83 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306797  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3626  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
425 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2488  transposase, IS605 OrfB family  32.06 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5480  IS605 family transposase OrfB  32.11 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.92096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0681  transposase, IS605 OrfB family  32.67 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146428  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1116  transposase, IS605 OrfB family  31.98 
 
 
374 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.355527 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1200  transposase, IS605 OrfB family  31.98 
 
 
374 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0919979  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1692  transposase  32.42 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153302  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7429  transposase  33.08 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0563  transposase, IS605 OrfB family  32.23 
 
 
375 aa  131  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.11437 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3539  transposase, IS605 OrfB family  32.23 
 
 
375 aa  131  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.3879  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2198  transposase IS605  30.3 
 
 
368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6879  IS605 family transposase OrfB  32 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2493  transposase, IS605 OrfB family  29.67 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2941  transposase, IS605 OrfB family  29.43 
 
 
401 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1982  transposase, IS605 OrfB family  32.22 
 
 
351 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2549  transposase, IS605 OrfB family  30.64 
 
 
400 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2253  transposase  32.27 
 
 
264 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1399  transposase, IS605 OrfB family  29.57 
 
 
375 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2065  transposase, IS1341 family  29.63 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2374  transposase, IS605 OrfB family  29.97 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2125  transposase, IS605 OrfB family  30.71 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00617237  decreased coverage  0.0000396034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3343  transposase, IS605 OrfB family  33.01 
 
 
351 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2741  transposase, IS605 OrfB  30.48 
 
 
518 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230719  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2211  transposase IS605  30.49 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2685  transposase, IS605 OrfB family  31.49 
 
 
351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0861  transposase, IS1341 family  29.07 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2840  transposase, IS605 OrfB family  30.56 
 
 
351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3375  transposase, IS605 OrfB family  26.44 
 
 
412 aa  117  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3391  transposase, IS605 OrfB family  27.14 
 
 
415 aa  117  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1635  transposase, IS605 OrfB family  28.85 
 
 
351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2621  transposase, IS605 OrfB family  26.44 
 
 
412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2686  transposase  30.34 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.442816  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0680  transposase, IS605 OrfB  29.75 
 
 
414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4063  transposase, IS1341 family  28.47 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2561  transposase, IS605 OrfB family  27.03 
 
 
440 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467488  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4128  transposase, IS605 OrfB family  26.16 
 
 
397 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.431566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0877  IS605 family transposase OrfB  29.77 
 
 
372 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000122455  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0996  transposase, IS605 OrfB family  27.5 
 
 
409 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2854  transposase, IS605 OrfB family  28.88 
 
 
403 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4652  transposase, IS1341 family  28.47 
 
 
400 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000354278 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1086  transposase, IS605 OrfB family  26.1 
 
 
434 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  30.21 
 
 
413 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  30.34 
 
 
411 aa  103  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0136  transposase, IS605 OrfB family  25.42 
 
 
415 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3030  transposase, IS605 OrfB family  27.65 
 
 
396 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  29.35 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>