More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0117 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1777  IS605 family transposase OrfB  93.46 
 
 		 382 aa  725    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.872149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0141  IS605 family transposase OrfB  94.57 
 
 		 368 aa  719    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0206  IS605 family transposase OrfB  94.84 
 
 		 368 aa  718    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107304  normal  0.275881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0197  IS605 family transposase OrfB  96.74 
 
 		 368 aa  734    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374604  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2274  IS605 family transposase OrfB  94.84 
 
 		 368 aa  720    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.683357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0367  IS605 family transposase OrfB  87.23 
 
 		 368 aa  669    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292171  hitchhiker  0.000610629 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0626  IS605 family transposase OrfB  94.57 
 
 		 368 aa  723    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1669  IS605 family transposase OrfB  95.65 
 
 		 368 aa  728    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0603  IS605 family transposase OrfB  95.11 
 
 		 367 aa  714    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1392  IS605 family transposase OrfB  94.57 
 
 		 368 aa  715    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1710  IS605 family transposase OrfB  97.55 
 
 		 368 aa  736    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1070  IS605 family transposase OrfB  96.2 
 
 		 368 aa  732    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0178  IS605 family transposase OrfB  95.38 
 
 		 368 aa  728    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.116518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1078  IS605 family transposase OrfB  94.02 
 
 		 368 aa  712    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2014  IS605 family transposase OrfB  92.12 
 
 		 368 aa  701    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1918  IS605 family transposase OrfB  93.75 
 
 		 368 aa  712    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0117  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 368 aa  757    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0195  IS605 family transposase OrfB  97.01 
 
 		 368 aa  739    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522338  hitchhiker  0.00591521 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2229  IS605 family transposase OrfB  87.23 
 
 		 368 aa  674    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.626337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4095  IS605 family transposase OrfB  51.08 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1587  transposase  48.4 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1058  IS605 family transposase OrfB  39.34 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.14172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3402  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  45.56 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.585947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3151  IS605 family transposase OrfB  38.5 
 
 		 355 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2028  IS605 family transposase OrfB  39.44 
 
 		 350 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971248  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6049  transposase, IS605 OrfB  39.44 
 
 		 350 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3232  transposase, IS605 OrfB  39.39 
 
 		 353 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0466182  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5135  IS605 family transposase OrfB  39.39 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5305  IS605 family transposase OrfB  39.5 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5405  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3834  IS605 family transposase OrfB  39.44 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.885241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5061  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 		 350 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3363  IS605 family transposase OrfB  39.44 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3911  IS605 family transposase OrfB  39.22 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6181  IS605 family transposase OrfB  38.59 
 
 		 350 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5338  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 		 350 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6039  IS605 family transposase OrfB  38.83 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.767998  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1598  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5909  IS605 family transposase OrfB  38.66 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5884  IS605 family transposase OrfB  38.61 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.225527 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6014  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5544  transposase, IS605 OrfB  38.66 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4247  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  normal  0.0328861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4129  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426734 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3387  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6095  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6476  IS605 family transposase OrfB  38.48 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.037222  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4780  transposase, IS605 OrfB  39.15 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4147  IS605 family transposase OrfB  39.22 
 
 		 350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0972237  normal  0.0676956 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5249  IS605 family transposase OrfB  38.89 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3118  transposase, IS605 OrfB  38.89 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3435  IS605 family transposase OrfB  38.59 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0563204  normal  0.146196 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1192  IS605 family transposase OrfB  38.27 
 
 		 353 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0713  transposase, IS605 OrfB  38.27 
 
 		 353 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3743  IS605 family transposase OrfB  38.03 
 
 		 350 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1613  IS605 family transposase OrfB  38.31 
 
 		 350 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5462  IS605 family transposase OrfB  38.59 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1547  IS605 family transposase OrfB  38.03 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4308  IS605 family transposase OrfB  38.1 
 
 		 350 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0403457  normal  0.908635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4217  IS605 family transposase OrfB  38.03 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.513671 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5122  IS605 family transposase OrfB  38.59 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.331521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  39.04 
 
 		 416 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.16 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  38.16 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  36.94 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  36.68 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  35.53 
 
 		 381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  35.13 
 
 		 391 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  35.19 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3404  transposase, IS605 OrfB  68.09 
 
 		 96 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.16 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  30.35 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  33.74 
 
 		 406 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  34.65 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  34.65 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.09 
 
 		 376 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  35.09 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.17 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  34.85 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  34.69 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  40 
 
 		 362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  25.98 
 
 		 410 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  28.86 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  34.68 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  28.86 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  32.33 
 
 		 381 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  36.52 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  31.86 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  30.49 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  35.12 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  29.72 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.33 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  30.86 
 
 		 375 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  30.29 
 
 		 403 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  35.19 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  32.26 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  33.33 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  33.33 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  34.72 
 
 		 370 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  34.74 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>