More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5338 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5135  IS605 family transposase OrfB  95.43 
 
 		 353 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5249  IS605 family transposase OrfB  95.14 
 
 		 350 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6014  IS605 family transposase OrfB  96 
 
 		 350 aa  698    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6476  IS605 family transposase OrfB  96.29 
 
 		 350 aa  700    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.037222  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5909  IS605 family transposase OrfB  95.97 
 
 		 350 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3387  IS605 family transposase OrfB  95.14 
 
 		 350 aa  693    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3834  IS605 family transposase OrfB  97.41 
 
 		 350 aa  700    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.885241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0713  transposase, IS605 OrfB  95.14 
 
 		 353 aa  695    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3118  transposase, IS605 OrfB  95.14 
 
 		 350 aa  688    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3232  transposase, IS605 OrfB  95.14 
 
 		 353 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0466182  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4780  transposase, IS605 OrfB  95.14 
 
 		 350 aa  693    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5544  transposase, IS605 OrfB  95.97 
 
 		 350 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6049  transposase, IS605 OrfB  96.25 
 
 		 350 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5462  IS605 family transposase OrfB  95.43 
 
 		 350 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6039  IS605 family transposase OrfB  95.14 
 
 		 350 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.767998  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1598  IS605 family transposase OrfB  95.71 
 
 		 350 aa  698    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1613  IS605 family transposase OrfB  95.97 
 
 		 350 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4308  IS605 family transposase OrfB  96 
 
 		 350 aa  693    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0403457  normal  0.908635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6095  IS605 family transposase OrfB  96.83 
 
 		 350 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4147  IS605 family transposase OrfB  95.71 
 
 		 350 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0972237  normal  0.0676956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4217  IS605 family transposase OrfB  95.71 
 
 		 350 aa  691    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.513671 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4129  IS605 family transposase OrfB  95.43 
 
 		 350 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5884  IS605 family transposase OrfB  95.71 
 
 		 398 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.225527 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5305  IS605 family transposase OrfB  96 
 
 		 350 aa  700    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1547  IS605 family transposase OrfB  95.43 
 
 		 350 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3363  IS605 family transposase OrfB  94.29 
 
 		 350 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3435  IS605 family transposase OrfB  97.14 
 
 		 350 aa  707    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0563204  normal  0.146196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3743  IS605 family transposase OrfB  94.86 
 
 		 350 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3911  IS605 family transposase OrfB  96.29 
 
 		 350 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4247  IS605 family transposase OrfB  97.14 
 
 		 350 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  normal  0.0328861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5061  IS605 family transposase OrfB  95.43 
 
 		 350 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5122  IS605 family transposase OrfB  94.05 
 
 		 353 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.331521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5338  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 350 aa  721    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5405  IS605 family transposase OrfB  95.43 
 
 		 350 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6181  IS605 family transposase OrfB  97.14 
 
 		 350 aa  709    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1192  IS605 family transposase OrfB  95.14 
 
 		 353 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2028  IS605 family transposase OrfB  96.25 
 
 		 350 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971248  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1058  IS605 family transposase OrfB  68.44 
 
 		 355 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.14172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3151  IS605 family transposase OrfB  68.17 
 
 		 355 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5935  hypothetical protein  93.89 
 
 		 200 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0589916 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0125  transposase, IS605 OrfB  94.49 
 
 		 142 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0608  IS605 family transposase OrfB  94.49 
 
 		 142 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3944  transposase, IS605 OrfB  94.4 
 
 		 194 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4422  transposase, IS605 OrfB  94.4 
 
 		 194 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4095  IS605 family transposase OrfB  42.27 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1587  transposase  40.52 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1918  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 		 368 aa  209  8e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0367  IS605 family transposase OrfB  38.94 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292171  hitchhiker  0.000610629 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2014  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0603  IS605 family transposase OrfB  39.5 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1078  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2229  IS605 family transposase OrfB  38.66 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.626337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0195  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522338  hitchhiker  0.00591521 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1710  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 		 368 aa  206  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0206  IS605 family transposase OrfB  38.59 
 
 		 368 aa  205  8e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107304  normal  0.275881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1669  IS605 family transposase OrfB  39.19 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0141  IS605 family transposase OrfB  38.38 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1392  IS605 family transposase OrfB  38.59 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0178  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.116518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0197  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374604  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0117  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1070  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 		 368 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0626  IS605 family transposase OrfB  38.03 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2274  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.683357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1777  IS605 family transposase OrfB  37.67 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.872149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  37.34 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  37.71 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  40.16 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  40.76 
 
 		 417 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  36.55 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  38.53 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  35.93 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  35.5 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1540  IS605 family transposase OrfB  42 
 
 		 223 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  38.63 
 
 		 385 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  39.11 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  35.5 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  38.67 
 
 		 370 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  34.45 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.03 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  28.49 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.86 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  34.09 
 
 		 373 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  28.49 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  34.03 
 
 		 403 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  35.97 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  34.03 
 
 		 403 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  35.97 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  34.03 
 
 		 403 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  34.03 
 
 		 403 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  35.71 
 
 		 405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  34.39 
 
 		 373 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.84 
 
 		 373 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.84 
 
 		 373 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.84 
 
 		 373 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.39 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  37.91 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  35.02 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  34.39 
 
 		 372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>