More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1777 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0141  IS605 family transposase OrfB  91.88 
 
 
368 aa  715    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1669  IS605 family transposase OrfB  93.46 
 
 
368 aa  724    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382916  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1070  IS605 family transposase OrfB  91.88 
 
 
368 aa  714    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0197  IS605 family transposase OrfB  93.98 
 
 
368 aa  729    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374604  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1777  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
382 aa  788    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.872149  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0178  IS605 family transposase OrfB  91.1 
 
 
368 aa  705    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.116518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0117  IS605 family transposase OrfB  93.46 
 
 
368 aa  725    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1710  IS605 family transposase OrfB  93.19 
 
 
368 aa  720    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1078  IS605 family transposase OrfB  91.36 
 
 
368 aa  713    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.491952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0206  IS605 family transposase OrfB  91.88 
 
 
368 aa  711    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107304  normal  0.275881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0626  IS605 family transposase OrfB  90.05 
 
 
368 aa  704    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.511455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1918  IS605 family transposase OrfB  91.62 
 
 
368 aa  711    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.794577  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2014  IS605 family transposase OrfB  88.22 
 
 
368 aa  683    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2274  IS605 family transposase OrfB  91.62 
 
 
368 aa  709    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.683357  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0367  IS605 family transposase OrfB  83.77 
 
 
368 aa  657    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292171  hitchhiker  0.000610629 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0603  IS605 family transposase OrfB  90.84 
 
 
367 aa  697    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602686  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0195  IS605 family transposase OrfB  92.67 
 
 
368 aa  716    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522338  hitchhiker  0.00591521 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2229  IS605 family transposase OrfB  84.03 
 
 
368 aa  663    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.626337  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1392  IS605 family transposase OrfB  91.36 
 
 
368 aa  709    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4095  IS605 family transposase OrfB  49.22 
 
 
385 aa  345  8.999999999999999e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1587  transposase  46.21 
 
 
363 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1058  IS605 family transposase OrfB  38.44 
 
 
355 aa  227  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.14172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3402  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  43.66 
 
 
255 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.585947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3151  IS605 family transposase OrfB  37.63 
 
 
355 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2028  IS605 family transposase OrfB  38.23 
 
 
350 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971248  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6049  transposase, IS605 OrfB  38.23 
 
 
350 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5305  IS605 family transposase OrfB  38.23 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0621738  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3232  transposase, IS605 OrfB  37.9 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0466182  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3363  IS605 family transposase OrfB  38.21 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5135  IS605 family transposase OrfB  37.9 
 
 
353 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5405  IS605 family transposase OrfB  37.95 
 
 
350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3834  IS605 family transposase OrfB  38.23 
 
 
350 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.885241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3911  IS605 family transposase OrfB  37.95 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5061  IS605 family transposase OrfB  37.67 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149443  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1598  IS605 family transposase OrfB  37.67 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6181  IS605 family transposase OrfB  37.4 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252377  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5909  IS605 family transposase OrfB  37.4 
 
 
350 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5544  transposase, IS605 OrfB  37.4 
 
 
350 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5338  IS605 family transposase OrfB  37.67 
 
 
350 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6476  IS605 family transposase OrfB  37.95 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.037222  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6039  IS605 family transposase OrfB  37.37 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.767998  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5884  IS605 family transposase OrfB  37.1 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.225527 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6014  IS605 family transposase OrfB  37.67 
 
 
350 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4247  IS605 family transposase OrfB  37.67 
 
 
350 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  normal  0.0328861 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6095  IS605 family transposase OrfB  37.95 
 
 
350 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4147  IS605 family transposase OrfB  37.95 
 
 
350 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0972237  normal  0.0676956 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5249  IS605 family transposase OrfB  37.37 
 
 
350 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3118  transposase, IS605 OrfB  37.37 
 
 
350 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4129  IS605 family transposase OrfB  38.33 
 
 
350 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.426734 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3435  IS605 family transposase OrfB  37.4 
 
 
350 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0563204  normal  0.146196 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3387  IS605 family transposase OrfB  38.33 
 
 
350 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1192  IS605 family transposase OrfB  37.4 
 
 
353 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0713  transposase, IS605 OrfB  37.4 
 
 
353 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4780  transposase, IS605 OrfB  38.33 
 
 
350 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1613  IS605 family transposase OrfB  37.22 
 
 
350 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3743  IS605 family transposase OrfB  36.84 
 
 
350 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329544  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1547  IS605 family transposase OrfB  36.84 
 
 
350 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5462  IS605 family transposase OrfB  36.96 
 
 
350 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4308  IS605 family transposase OrfB  36.84 
 
 
350 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0403457  normal  0.908635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4217  IS605 family transposase OrfB  36.84 
 
 
350 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.513671 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5122  IS605 family transposase OrfB  37.12 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.331521 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  38.74 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.72 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  36.94 
 
 
368 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  38.16 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  37.72 
 
 
416 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  38.7 
 
 
391 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  38.03 
 
 
391 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.16 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  35.09 
 
 
381 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  33.92 
 
 
406 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.48 
 
 
381 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  34.65 
 
 
408 aa  123  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.37 
 
 
376 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3404  transposase, IS605 OrfB  65.96 
 
 
96 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  40 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  34.44 
 
 
424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  31.62 
 
 
417 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  32.43 
 
 
405 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  33.77 
 
 
410 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  34.21 
 
 
410 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  34.74 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  32.33 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  34.23 
 
 
390 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.76 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  37.23 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  30.63 
 
 
410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  35.12 
 
 
393 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  37.89 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  27.52 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  32.72 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  27.52 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  31.8 
 
 
435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  33.81 
 
 
398 aa  110  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  33.81 
 
 
398 aa  110  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
383 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  32.99 
 
 
375 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  32.43 
 
 
405 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1991  transposase  27.09 
 
 
383 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166547  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  33.81 
 
 
398 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>