More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1587 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1587  transposase  100 
 
 
363 aa  758    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4095  IS605 family transposase OrfB  57.06 
 
 
385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2014  IS605 family transposase OrfB  48.81 
 
 
368 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0206  IS605 family transposase OrfB  48.55 
 
 
368 aa  319  6e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107304  normal  0.275881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0117  IS605 family transposase OrfB  48.4 
 
 
368 aa  318  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1669  IS605 family transposase OrfB  48.02 
 
 
368 aa  317  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382916  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0178  IS605 family transposase OrfB  47.76 
 
 
368 aa  317  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.116518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0195  IS605 family transposase OrfB  47.49 
 
 
368 aa  317  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522338  hitchhiker  0.00591521 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1918  IS605 family transposase OrfB  47.76 
 
 
368 aa  315  8e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.794577  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1710  IS605 family transposase OrfB  48.02 
 
 
368 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0197  IS605 family transposase OrfB  48.02 
 
 
368 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374604  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0626  IS605 family transposase OrfB  47.49 
 
 
368 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.511455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1777  IS605 family transposase OrfB  46.21 
 
 
382 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.872149  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1078  IS605 family transposase OrfB  47.76 
 
 
368 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.491952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1392  IS605 family transposase OrfB  48.14 
 
 
368 aa  310  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0141  IS605 family transposase OrfB  47.49 
 
 
368 aa  309  4e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0603  IS605 family transposase OrfB  47.23 
 
 
367 aa  309  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602686  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1070  IS605 family transposase OrfB  47.23 
 
 
368 aa  309  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2274  IS605 family transposase OrfB  46.97 
 
 
368 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.683357  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2229  IS605 family transposase OrfB  47.34 
 
 
368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.626337  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0367  IS605 family transposase OrfB  47.87 
 
 
368 aa  302  5.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292171  hitchhiker  0.000610629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1058  IS605 family transposase OrfB  45.33 
 
 
355 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.14172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3151  IS605 family transposase OrfB  44.03 
 
 
355 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3402  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  53.03 
 
 
255 aa  259  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.585947 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3232  transposase, IS605 OrfB  40.05 
 
 
353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0466182  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5884  IS605 family transposase OrfB  39.78 
 
 
398 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.225527 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5135  IS605 family transposase OrfB  39.78 
 
 
353 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6476  IS605 family transposase OrfB  40.8 
 
 
350 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.037222  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3118  transposase, IS605 OrfB  41.67 
 
 
350 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3435  IS605 family transposase OrfB  41.09 
 
 
350 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0563204  normal  0.146196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5405  IS605 family transposase OrfB  40.8 
 
 
350 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5249  IS605 family transposase OrfB  41.67 
 
 
350 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5305  IS605 family transposase OrfB  40.52 
 
 
350 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0621738  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6181  IS605 family transposase OrfB  40.52 
 
 
350 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252377  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6039  IS605 family transposase OrfB  40.8 
 
 
350 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.767998  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5544  transposase, IS605 OrfB  40.87 
 
 
350 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5909  IS605 family transposase OrfB  40.87 
 
 
350 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6014  IS605 family transposase OrfB  40.8 
 
 
350 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4129  IS605 family transposase OrfB  41.38 
 
 
350 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.426734 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3911  IS605 family transposase OrfB  40.52 
 
 
350 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4780  transposase, IS605 OrfB  41.38 
 
 
350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5061  IS605 family transposase OrfB  40.52 
 
 
350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149443  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4147  IS605 family transposase OrfB  40.8 
 
 
350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0972237  normal  0.0676956 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3387  IS605 family transposase OrfB  41.38 
 
 
350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3363  IS605 family transposase OrfB  40.52 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5338  IS605 family transposase OrfB  40.52 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0713  transposase, IS605 OrfB  39.51 
 
 
353 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4247  IS605 family transposase OrfB  40.23 
 
 
350 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  normal  0.0328861 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1192  IS605 family transposase OrfB  39.51 
 
 
353 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6049  transposase, IS605 OrfB  40 
 
 
350 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2028  IS605 family transposase OrfB  40 
 
 
350 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971248  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3834  IS605 family transposase OrfB  40.23 
 
 
350 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.885241 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6095  IS605 family transposase OrfB  40.52 
 
 
350 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1598  IS605 family transposase OrfB  39.94 
 
 
350 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3743  IS605 family transposase OrfB  39.94 
 
 
350 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329544  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1613  IS605 family transposase OrfB  40.65 
 
 
350 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4308  IS605 family transposase OrfB  40.23 
 
 
350 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0403457  normal  0.908635 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1547  IS605 family transposase OrfB  39.94 
 
 
350 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5462  IS605 family transposase OrfB  40.58 
 
 
350 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4217  IS605 family transposase OrfB  39.94 
 
 
350 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.513671 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5122  IS605 family transposase OrfB  40.17 
 
 
353 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.331521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3404  transposase, IS605 OrfB  71.88 
 
 
96 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.59 
 
 
381 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  38.5 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.2 
 
 
395 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  36.12 
 
 
410 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  34.48 
 
 
399 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  34.48 
 
 
399 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  32.81 
 
 
405 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  34.21 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  33.46 
 
 
368 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  35.24 
 
 
410 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  34.88 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  36.32 
 
 
435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.59 
 
 
381 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  33.58 
 
 
391 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  35.47 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  33.21 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1851  IS605 family transposase OrfB  36.32 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0641  IS605 family transposase OrfB  36.32 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133268  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  32.09 
 
 
390 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  32.83 
 
 
391 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  33.18 
 
 
373 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  33.18 
 
 
373 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  33.18 
 
 
373 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.83 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  32.74 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  34.23 
 
 
381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  32.74 
 
 
373 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  32.86 
 
 
373 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  35.14 
 
 
370 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  34.8 
 
 
410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.84 
 
 
391 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  34.68 
 
 
370 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.31 
 
 
381 aa  126  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  35.27 
 
 
377 aa  126  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  31.92 
 
 
408 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  32.87 
 
 
384 aa  126  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  32.29 
 
 
372 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
326 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>