More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3402 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3402  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.585947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4095  IS605 family transposase OrfB  90.94 
 
 		 385 aa  480  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1587  transposase  53.03 
 
 		 363 aa  259  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1392  IS605 family transposase OrfB  46.3 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0195  IS605 family transposase OrfB  45.93 
 
 		 368 aa  229  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522338  hitchhiker  0.00591521 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1669  IS605 family transposase OrfB  46.3 
 
 		 368 aa  230  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1918  IS605 family transposase OrfB  45.56 
 
 		 368 aa  228  7e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1078  IS605 family transposase OrfB  45.56 
 
 		 368 aa  228  8e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0141  IS605 family transposase OrfB  45.56 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0117  IS605 family transposase OrfB  45.56 
 
 		 368 aa  226  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1710  IS605 family transposase OrfB  45.56 
 
 		 368 aa  226  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0206  IS605 family transposase OrfB  45.9 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107304  normal  0.275881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0197  IS605 family transposase OrfB  45.93 
 
 		 368 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374604  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1777  IS605 family transposase OrfB  43.66 
 
 		 382 aa  225  6e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.872149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0626  IS605 family transposase OrfB  44.81 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0603  IS605 family transposase OrfB  45.19 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1070  IS605 family transposase OrfB  44.81 
 
 		 368 aa  221  9e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0178  IS605 family transposase OrfB  44.81 
 
 		 368 aa  219  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.116518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2014  IS605 family transposase OrfB  45.56 
 
 		 368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2274  IS605 family transposase OrfB  44.81 
 
 		 368 aa  218  7e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.683357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2229  IS605 family transposase OrfB  43.28 
 
 		 368 aa  208  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.626337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0367  IS605 family transposase OrfB  43.28 
 
 		 368 aa  205  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292171  hitchhiker  0.000610629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2857  hypothetical protein  93.59 
 
 		 100 aa  154  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0368984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3151  IS605 family transposase OrfB  40.16 
 
 		 355 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1058  IS605 family transposase OrfB  40.16 
 
 		 355 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.14172 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5305  IS605 family transposase OrfB  37.04 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4147  IS605 family transposase OrfB  37.45 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0972237  normal  0.0676956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3911  IS605 family transposase OrfB  37.04 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6039  IS605 family transposase OrfB  37.86 
 
 		 350 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.767998  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3363  IS605 family transposase OrfB  37.45 
 
 		 350 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3435  IS605 family transposase OrfB  37.86 
 
 		 350 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0563204  normal  0.146196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1598  IS605 family transposase OrfB  36.63 
 
 		 350 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6049  transposase, IS605 OrfB  37.08 
 
 		 350 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6095  IS605 family transposase OrfB  37.86 
 
 		 350 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6476  IS605 family transposase OrfB  37.04 
 
 		 350 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.037222  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2028  IS605 family transposase OrfB  37.08 
 
 		 350 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971248  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3118  transposase, IS605 OrfB  37.86 
 
 		 350 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3232  transposase, IS605 OrfB  37.45 
 
 		 353 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0466182  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3834  IS605 family transposase OrfB  37.04 
 
 		 350 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.885241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4247  IS605 family transposase OrfB  37.04 
 
 		 350 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  normal  0.0328861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5249  IS605 family transposase OrfB  37.86 
 
 		 350 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1613  IS605 family transposase OrfB  37.55 
 
 		 350 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5462  IS605 family transposase OrfB  37.45 
 
 		 350 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5061  IS605 family transposase OrfB  36.63 
 
 		 350 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5405  IS605 family transposase OrfB  36.63 
 
 		 350 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5135  IS605 family transposase OrfB  37.45 
 
 		 353 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5909  IS605 family transposase OrfB  37.45 
 
 		 350 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5544  transposase, IS605 OrfB  37.45 
 
 		 350 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1547  IS605 family transposase OrfB  37.14 
 
 		 350 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6181  IS605 family transposase OrfB  36.63 
 
 		 350 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5884  IS605 family transposase OrfB  36.63 
 
 		 398 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.225527 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0713  transposase, IS605 OrfB  37.04 
 
 		 353 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5338  IS605 family transposase OrfB  36.63 
 
 		 350 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1192  IS605 family transposase OrfB  37.04 
 
 		 353 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4129  IS605 family transposase OrfB  37.86 
 
 		 350 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426734 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6014  IS605 family transposase OrfB  36.63 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4780  transposase, IS605 OrfB  37.86 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3387  IS605 family transposase OrfB  37.86 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3743  IS605 family transposase OrfB  35.8 
 
 		 350 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4217  IS605 family transposase OrfB  36.21 
 
 		 350 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.513671 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4308  IS605 family transposase OrfB  36.21 
 
 		 350 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0403457  normal  0.908635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5122  IS605 family transposase OrfB  35.51 
 
 		 353 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.331521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2566  hypothetical protein  85.96 
 
 		 89 aa  105  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.133361  hitchhiker  0.000771324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  32.39 
 
 		 405 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  29.14 
 
 		 410 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  30.68 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  36 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  32 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  33.88 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  36.97 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  30.6 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  33.06 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  36.13 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  36.13 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  29.1 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  36.13 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  36.13 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  29.31 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  36.13 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  36.13 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  32.33 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  35.29 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  29.37 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  32.58 
 
 		 399 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  32.58 
 
 		 399 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  29.85 
 
 		 370 aa  65.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.07 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  31.29 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  29.89 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  34.96 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  24.9 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  36 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  30.3 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  23.76 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  32.31 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5935  hypothetical protein  31.78 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0589916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  35.29 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  32.31 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  32.31 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  32.31 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>