64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2857 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2857  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  209  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0368984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3402  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  93.59 
 
 
255 aa  154  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.585947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4095  IS605 family transposase OrfB  93.59 
 
 
385 aa  152  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2566  hypothetical protein  86.05 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.133361  hitchhiker  0.000771324 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0195  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
368 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522338  hitchhiker  0.00591521 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0603  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
367 aa  76.6  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602686  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1777  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
382 aa  76.6  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.872149  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1392  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0117  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0206  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107304  normal  0.275881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1078  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.491952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1669  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382916  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1710  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2014  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0197  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
368 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374604  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0141  IS605 family transposase OrfB  48.75 
 
 
368 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2274  IS605 family transposase OrfB  48.75 
 
 
368 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.683357  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1070  IS605 family transposase OrfB  48.75 
 
 
368 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1918  IS605 family transposase OrfB  48.75 
 
 
368 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.794577  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0178  IS605 family transposase OrfB  48.75 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.116518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2229  IS605 family transposase OrfB  46.25 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.626337  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0626  IS605 family transposase OrfB  46.25 
 
 
368 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.511455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0367  IS605 family transposase OrfB  46.25 
 
 
368 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292171  hitchhiker  0.000610629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1587  transposase  40.86 
 
 
363 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1058  IS605 family transposase OrfB  39.13 
 
 
355 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.14172 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3363  IS605 family transposase OrfB  38.46 
 
 
350 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5405  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5061  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149443  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6476  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.037222  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1598  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4147  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0972237  normal  0.0676956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4217  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.513671 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4308  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0403457  normal  0.908635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6095  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4247  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  normal  0.0328861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3911  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1547  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3151  IS605 family transposase OrfB  39.13 
 
 
355 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5249  IS605 family transposase OrfB  34.67 
 
 
350 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3118  transposase, IS605 OrfB  34.67 
 
 
350 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5462  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5305  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0621738  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3834  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.885241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1613  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5122  IS605 family transposase OrfB  36.51 
 
 
353 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.331521 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6039  IS605 family transposase OrfB  37.31 
 
 
350 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.767998  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4129  IS605 family transposase OrfB  36.23 
 
 
350 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.426734 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0713  transposase, IS605 OrfB  37.31 
 
 
353 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4780  transposase, IS605 OrfB  36.23 
 
 
350 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6049  transposase, IS605 OrfB  35.82 
 
 
350 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3435  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0563204  normal  0.146196 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1192  IS605 family transposase OrfB  37.31 
 
 
353 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2028  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3387  IS605 family transposase OrfB  36.23 
 
 
350 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5135  IS605 family transposase OrfB  34.78 
 
 
353 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6181  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
350 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252377  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3232  transposase, IS605 OrfB  34.78 
 
 
353 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0466182  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6014  IS605 family transposase OrfB  34.33 
 
 
350 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5884  IS605 family transposase OrfB  34.33 
 
 
398 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.225527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3743  IS605 family transposase OrfB  32.84 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329544  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5338  IS605 family transposase OrfB  34.33 
 
 
350 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5544  transposase, IS605 OrfB  33.33 
 
 
350 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5909  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
350 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5935  hypothetical protein  34.92 
 
 
200 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0589916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>