More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0197 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1078  IS605 family transposase OrfB  94.84 
 
 
368 aa  718    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.491952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0141  IS605 family transposase OrfB  95.11 
 
 
368 aa  723    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1392  IS605 family transposase OrfB  94.57 
 
 
368 aa  716    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2274  IS605 family transposase OrfB  94.29 
 
 
368 aa  714    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.683357  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2229  IS605 family transposase OrfB  87.5 
 
 
368 aa  675    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.626337  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1710  IS605 family transposase OrfB  97.01 
 
 
368 aa  732    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1777  IS605 family transposase OrfB  93.98 
 
 
382 aa  729    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.872149  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1669  IS605 family transposase OrfB  96.2 
 
 
368 aa  726    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382916  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0178  IS605 family transposase OrfB  96.47 
 
 
368 aa  729    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.116518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1918  IS605 family transposase OrfB  94.29 
 
 
368 aa  716    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.794577  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0626  IS605 family transposase OrfB  93.75 
 
 
368 aa  716    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.511455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0603  IS605 family transposase OrfB  94.02 
 
 
367 aa  705    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602686  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0117  IS605 family transposase OrfB  96.74 
 
 
368 aa  734    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0197  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
368 aa  759    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374604  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0367  IS605 family transposase OrfB  87.23 
 
 
368 aa  669    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292171  hitchhiker  0.000610629 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0195  IS605 family transposase OrfB  95.92 
 
 
368 aa  725    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522338  hitchhiker  0.00591521 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2014  IS605 family transposase OrfB  92.39 
 
 
368 aa  698    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0206  IS605 family transposase OrfB  95.11 
 
 
368 aa  719    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107304  normal  0.275881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1070  IS605 family transposase OrfB  95.65 
 
 
368 aa  726    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4095  IS605 family transposase OrfB  50.81 
 
 
385 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1587  transposase  48.02 
 
 
363 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1058  IS605 family transposase OrfB  39.94 
 
 
355 aa  227  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.14172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3402  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  45.93 
 
 
255 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.585947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3151  IS605 family transposase OrfB  39.11 
 
 
355 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2028  IS605 family transposase OrfB  39.44 
 
 
350 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971248  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6049  transposase, IS605 OrfB  39.44 
 
 
350 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3363  IS605 family transposase OrfB  39.72 
 
 
350 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3232  transposase, IS605 OrfB  39.39 
 
 
353 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0466182  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5305  IS605 family transposase OrfB  39.44 
 
 
350 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0621738  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5135  IS605 family transposase OrfB  39.39 
 
 
353 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5405  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 
350 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3834  IS605 family transposase OrfB  39.44 
 
 
350 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.885241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5061  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 
350 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149443  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3911  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 
350 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1598  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 
350 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6181  IS605 family transposase OrfB  38.59 
 
 
350 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252377  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5884  IS605 family transposase OrfB  38.61 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.225527 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6039  IS605 family transposase OrfB  38.83 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.767998  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6014  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5544  transposase, IS605 OrfB  38.66 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5909  IS605 family transposase OrfB  38.66 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4247  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  normal  0.0328861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5338  IS605 family transposase OrfB  38.87 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5249  IS605 family transposase OrfB  38.83 
 
 
350 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3118  transposase, IS605 OrfB  38.83 
 
 
350 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4147  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 
350 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0972237  normal  0.0676956 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6095  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 
350 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6476  IS605 family transposase OrfB  38.59 
 
 
350 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.037222  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4129  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 
350 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.426734 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3387  IS605 family transposase OrfB  39.15 
 
 
350 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4780  transposase, IS605 OrfB  39.15 
 
 
350 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3435  IS605 family transposase OrfB  38.59 
 
 
350 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0563204  normal  0.146196 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1192  IS605 family transposase OrfB  38.27 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0713  transposase, IS605 OrfB  38.27 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1613  IS605 family transposase OrfB  38.31 
 
 
350 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3743  IS605 family transposase OrfB  38.03 
 
 
350 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329544  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1547  IS605 family transposase OrfB  38.03 
 
 
350 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5462  IS605 family transposase OrfB  38.31 
 
 
350 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4308  IS605 family transposase OrfB  38.03 
 
 
350 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0403457  normal  0.908635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4217  IS605 family transposase OrfB  38.03 
 
 
350 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.513671 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5122  IS605 family transposase OrfB  38.59 
 
 
353 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.331521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.84 
 
 
381 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  36.84 
 
 
373 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  36.49 
 
 
368 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  35.69 
 
 
391 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  34.51 
 
 
391 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  34.24 
 
 
391 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  34.96 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  37.28 
 
 
416 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  33.77 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  35.09 
 
 
408 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  32.92 
 
 
406 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3404  transposase, IS605 OrfB  65.96 
 
 
96 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.09 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  34.06 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.04 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  39.38 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  33.86 
 
 
410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  34.85 
 
 
424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  35.26 
 
 
377 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  29.64 
 
 
405 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  33.77 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  32.74 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  28.86 
 
 
404 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  32.76 
 
 
381 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  28.86 
 
 
404 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  27.16 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  35.22 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  35.12 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  31.47 
 
 
381 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.31 
 
 
403 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  32.26 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  31.3 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  32.26 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  30.29 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  33.77 
 
 
326 aa  110  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  29.37 
 
 
405 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  30.91 
 
 
403 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  33.02 
 
 
383 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1991  transposase  26.77 
 
 
383 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>