More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4095 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_4095  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
385 aa  795    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3402  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  90.94 
 
 
255 aa  480  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.585947 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1587  transposase  57.06 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0206  IS605 family transposase OrfB  51.62 
 
 
368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107304  normal  0.275881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0195  IS605 family transposase OrfB  51.08 
 
 
368 aa  355  8.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522338  hitchhiker  0.00591521 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0117  IS605 family transposase OrfB  51.08 
 
 
368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1669  IS605 family transposase OrfB  50.81 
 
 
368 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382916  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1918  IS605 family transposase OrfB  50.54 
 
 
368 aa  350  3e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.794577  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1710  IS605 family transposase OrfB  50.81 
 
 
368 aa  349  5e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1392  IS605 family transposase OrfB  50.54 
 
 
368 aa  349  5e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2014  IS605 family transposase OrfB  50.54 
 
 
368 aa  348  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0197  IS605 family transposase OrfB  50.81 
 
 
368 aa  347  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374604  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0141  IS605 family transposase OrfB  50.27 
 
 
368 aa  347  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0626  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
368 aa  347  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.511455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0178  IS605 family transposase OrfB  50.27 
 
 
368 aa  345  6e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.116518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1078  IS605 family transposase OrfB  49.73 
 
 
368 aa  345  7e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.491952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1777  IS605 family transposase OrfB  49.22 
 
 
382 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.872149  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0603  IS605 family transposase OrfB  50.27 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602686  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1070  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
368 aa  341  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2274  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
368 aa  341  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.683357  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2229  IS605 family transposase OrfB  48.92 
 
 
368 aa  333  2e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.626337  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0367  IS605 family transposase OrfB  49.19 
 
 
368 aa  332  8e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292171  hitchhiker  0.000610629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1058  IS605 family transposase OrfB  48.14 
 
 
355 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.14172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3151  IS605 family transposase OrfB  47.55 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6476  IS605 family transposase OrfB  43.19 
 
 
350 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.037222  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3911  IS605 family transposase OrfB  42.9 
 
 
350 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5061  IS605 family transposase OrfB  42.86 
 
 
350 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149443  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3435  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0563204  normal  0.146196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6039  IS605 family transposase OrfB  43.19 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.767998  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4147  IS605 family transposase OrfB  42.61 
 
 
350 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0972237  normal  0.0676956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3232  transposase, IS605 OrfB  42.61 
 
 
353 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0466182  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5405  IS605 family transposase OrfB  42.27 
 
 
350 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3118  transposase, IS605 OrfB  43.48 
 
 
350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5249  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5338  IS605 family transposase OrfB  42.27 
 
 
350 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5135  IS605 family transposase OrfB  42.61 
 
 
353 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5462  IS605 family transposase OrfB  43.19 
 
 
350 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6095  IS605 family transposase OrfB  42.9 
 
 
350 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1598  IS605 family transposase OrfB  41.74 
 
 
350 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5305  IS605 family transposase OrfB  41.74 
 
 
350 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0621738  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4247  IS605 family transposase OrfB  42.03 
 
 
350 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  normal  0.0328861 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6181  IS605 family transposase OrfB  42.03 
 
 
350 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252377  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1547  IS605 family transposase OrfB  41.4 
 
 
350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3834  IS605 family transposase OrfB  42.03 
 
 
350 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.885241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0713  transposase, IS605 OrfB  42.32 
 
 
353 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1613  IS605 family transposase OrfB  41.69 
 
 
350 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5884  IS605 family transposase OrfB  42.03 
 
 
398 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.225527 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1192  IS605 family transposase OrfB  42.32 
 
 
353 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3363  IS605 family transposase OrfB  42.03 
 
 
350 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3743  IS605 family transposase OrfB  41.45 
 
 
350 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329544  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6049  transposase, IS605 OrfB  41.74 
 
 
350 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2028  IS605 family transposase OrfB  41.74 
 
 
350 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971248  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6014  IS605 family transposase OrfB  41.74 
 
 
350 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4129  IS605 family transposase OrfB  43.64 
 
 
350 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.426734 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4308  IS605 family transposase OrfB  42.03 
 
 
350 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0403457  normal  0.908635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4780  transposase, IS605 OrfB  43.64 
 
 
350 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5544  transposase, IS605 OrfB  42.03 
 
 
350 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5909  IS605 family transposase OrfB  42.03 
 
 
350 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3387  IS605 family transposase OrfB  43.64 
 
 
350 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4217  IS605 family transposase OrfB  41.74 
 
 
350 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.513671 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5122  IS605 family transposase OrfB  41.95 
 
 
353 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.331521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3404  transposase, IS605 OrfB  87.5 
 
 
96 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2857  hypothetical protein  93.59 
 
 
100 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0368984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  32.48 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  33.85 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  29.32 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  35.09 
 
 
370 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  36.32 
 
 
417 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0125  transposase, IS605 OrfB  55 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0608  IS605 family transposase OrfB  55 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  34.65 
 
 
370 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  35.56 
 
 
410 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  30.32 
 
 
377 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  29.63 
 
 
395 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  37.5 
 
 
377 aa  122  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3944  transposase, IS605 OrfB  52.8 
 
 
194 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  35.71 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4422  transposase, IS605 OrfB  52.8 
 
 
194 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531267  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  35.12 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  31.75 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  29.81 
 
 
368 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  31.7 
 
 
403 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  31.7 
 
 
403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.46 
 
 
381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  31.7 
 
 
403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  31.7 
 
 
403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  31.7 
 
 
403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
416 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  31.14 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  28.83 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  30.27 
 
 
375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  32.29 
 
 
435 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  35.21 
 
 
363 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1851  IS605 family transposase OrfB  34.98 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0641  IS605 family transposase OrfB  34.98 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133268  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  31.71 
 
 
440 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  34.74 
 
 
363 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  34.74 
 
 
363 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  34.74 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>