136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5543 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 282 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  43.65 
 
 		 289 aa  208  7e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.64 
 
 		 271 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.28 
 
 		 372 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.14 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.22 
 
 		 261 aa  92.8  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.13 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.09 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.08 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.36 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.15 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.32 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  26.15 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.19 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35257  predicted protein  31.9 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109347  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  28.37 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.22 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  22.22 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  22.22 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  22.22 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.22 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.7 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.8 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.68 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  22.68 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  26.99 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  25.63 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  35.34 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0554  hypothetical protein  35.34 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.09 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  25.41 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.49 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  22.67 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.26 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.38 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  24.31 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.2 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.62 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.34 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  22.27 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  27.47 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5063  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.49 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15519  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1647  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.46 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.15 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  28.85 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.43 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  25.33 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  27.43 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  24.02 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  23.83 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  23.53 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.9 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.53 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.53 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.58 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.45 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6245  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.81 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  25.94 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  23.89 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  22.03 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  26.56 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  28 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.48 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.47 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  22.03 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  29.63 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.53 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.05 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5986  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.76 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  29.88 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.75 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  26.51 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.2 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.2 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  27.81 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.32 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.31 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.32 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.77 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  21.29 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  28 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  23.66 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.33 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.09 
 
 		 258 aa  49.7  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.67 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.88 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3969  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.74 
 
 		 382 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  27.61 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  26.97 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  27.11 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.67 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.4 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.51 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32238  predicted protein  29.03 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.194456 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.35 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>