104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2128 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  37.8 
 
 		 372 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.86 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.7 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  31.9 
 
 		 289 aa  92.4  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  31.15 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.91 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.71 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.87 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.03 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.68 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.72 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.56 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  26.7 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  26.92 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  26.7 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.7 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.7 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  26.37 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  41.77 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  27.43 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.33 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.84 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  31.41 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.3 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.96 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.81 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  31.61 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.76 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35257  predicted protein  29.65 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109347  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.67 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.27 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.25 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  30.43 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  27.16 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.44 
 
 		 260 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  27.59 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  27.59 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  28.48 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  24.53 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.62 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  32.28 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.32 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  24.4 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.07 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.72 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0554  hypothetical protein  31.5 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0114  hypothetical protein  41.1 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.715371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  33.33 
 
 		 331 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  33.33 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  24.3 
 
 		 354 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  24.3 
 
 		 352 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  24.3 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  24.56 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  31.76 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  27.27 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.45 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6245  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.13 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.51 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.4 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.4 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.3 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  25.91 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.63 
 
 		 263 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.63 
 
 		 263 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04647  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01850)  30.91 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.38 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  30.53 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  27.92 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  28.63 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.44 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5986  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.78 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.99 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  23.36 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  27.6 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.44 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  46.15 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.33 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.74 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  25 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.5 
 
 		 254 aa  46.2  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  29.73 
 
 		 254 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1417  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.91 
 
 		 267 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  27.59 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0935  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.89 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.63 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.53 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.8 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1023  hypothetical protein  23.85 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  25.35 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.27 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_85999  predicted protein  23.7 
 
 		 407 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5697  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.03 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.48 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>