158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6323 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
239 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  37.89 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.53 
 
 
273 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  36.6 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.12 
 
 
268 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.95 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.58 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.08 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.37 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  22.48 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.68 
 
 
296 aa  75.1  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.66 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  27.59 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  39.06 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.53 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.56 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.42 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  28.21 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.72 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.14 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.34 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.34 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  31.97 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.17 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  25.45 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.97 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.18 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.56 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.19 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.33 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.83 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  28 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.86 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.43 
 
 
281 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.27 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.27 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.4 
 
 
278 aa  62.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.82 
 
 
303 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.73 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.13 
 
 
293 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.03 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.93 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.93 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  28.99 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.73 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.87 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.05 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.66 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.29 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  27.61 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.62 
 
 
282 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  28.93 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.93 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.19 
 
 
372 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.93 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  32 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.99 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.15 
 
 
293 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  28.93 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  28.93 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  28.93 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  28.93 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  28.93 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.48 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  24.89 
 
 
301 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.91 
 
 
279 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  23.08 
 
 
304 aa  56.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  26.82 
 
 
301 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.82 
 
 
301 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.82 
 
 
301 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  23.94 
 
 
299 aa  55.8  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  25 
 
 
300 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 
274 aa  55.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 
394 aa  55.1  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 
394 aa  55.1  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  28.15 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.61 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.58 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  36.04 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  26.29 
 
 
307 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  26.29 
 
 
354 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  26.29 
 
 
307 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.94 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  26.29 
 
 
352 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  25 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  33.06 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.43 
 
 
320 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.58 
 
 
282 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  24.55 
 
 
298 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  29.79 
 
 
278 aa  52  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  25.81 
 
 
308 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  25.81 
 
 
308 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.61 
 
 
258 aa  52  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.22 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  29.17 
 
 
302 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  28.95 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>