73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  100 
 
 		 300 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  67.91 
 
 		 298 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  66.1 
 
 		 296 aa  398  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  60.68 
 
 		 302 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  56.4 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  55.1 
 
 		 304 aa  341  9e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  56.01 
 
 		 299 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  55.82 
 
 		 299 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  55.82 
 
 		 299 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  53.87 
 
 		 315 aa  323  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  51.38 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  51.72 
 
 		 304 aa  318  9e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  49.5 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  50.85 
 
 		 332 aa  309  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  52.45 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  50.17 
 
 		 314 aa  297  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  51.39 
 
 		 306 aa  295  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  46.67 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  50.18 
 
 		 306 aa  282  6.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  44.95 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  45.58 
 
 		 302 aa  257  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  34.51 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.6 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.09 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.17 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.09 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.7 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.3 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  24.69 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.44 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.75 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.37 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  24.51 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.34 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.87 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.26 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.68 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  23.85 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.84 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.23 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.32 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.32 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  23.59 
 
 		 268 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.82 
 
 		 274 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.64 
 
 		 258 aa  49.7  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.32 
 
 		 257 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.65 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.65 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  22.57 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.2 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.07 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.2 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.08 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.03 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1417  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.37 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  22.28 
 
 		 281 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.16 
 
 		 260 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  24.68 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.81 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.92 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.22 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37164  predicted protein  22.96 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.97 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  25.28 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.96 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  25.97 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25.97 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25.97 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  24.86 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.67 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41990  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.7 
 
 		 248 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>