69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5186 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 284 aa  592  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.94 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.69 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  34.77 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.28 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.85 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  36.26 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.1 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  34.07 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.05 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.13 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  29.09 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  32.08 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  31.39 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  32.32 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  30.07 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  28.2 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  28.83 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  29.26 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  28.99 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  31.7 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  30.48 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  31.7 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  31.7 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  28.72 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  31.67 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  29.48 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  27.68 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.79 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.57 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  27.27 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.64 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  25.98 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  27.88 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  27.62 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.58 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.84 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.84 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.67 
 
 		 281 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  24.22 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.54 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  24.22 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.22 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.79 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.79 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  24.22 
 
 		 253 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  24.22 
 
 		 253 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 		 263 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 		 263 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.92 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.52 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.39 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.55 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  22.66 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.16 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.86 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.53 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  26.04 
 
 		 253 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.55 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.326612 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  28.47 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32238  predicted protein  25.79 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.194456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  26.88 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.67 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.02 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>