89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2952 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  100 
 
 		 306 aa  633  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  66.78 
 
 		 306 aa  421  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  52.9 
 
 		 306 aa  335  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  51.17 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  49.82 
 
 		 304 aa  318  6e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  51.22 
 
 		 302 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  51.4 
 
 		 302 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  50.69 
 
 		 296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  50.18 
 
 		 300 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  50 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  50 
 
 		 314 aa  285  8e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  45.92 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  49.12 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  45.86 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  45.14 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  47.75 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  46.94 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  46.71 
 
 		 299 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  46.71 
 
 		 299 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  46.34 
 
 		 299 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  45.17 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.47 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  36.86 
 
 		 266 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.33 
 
 		 264 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.85 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.19 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.18 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.68 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.85 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.27 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  26.67 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  26.34 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.69 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.69 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  23.83 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  28.4 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.17 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  23.58 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.48 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.95 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  23.9 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.48 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.05 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.05 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.93 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.4 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.61 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.89 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.91 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.1 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.85 
 
 		 282 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.35 
 
 		 279 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.31 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  24.05 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.65 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4738  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.6 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3661  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.6 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.305414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.73 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.41 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.73 
 
 		 257 aa  49.3  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  23.39 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.24 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  23.39 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  23.39 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.79 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  23.39 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.39 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.98 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.95 
 
 		 261 aa  46.6  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.23 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.87 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.13 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.18 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37164  predicted protein  20.85 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0110  Phytanoyl-CoA dioxygenase  17.98 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.806567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.39 
 
 		 394 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.66 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0298  hypothetical protein  19.65 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.33 
 
 		 273 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.39 
 
 		 394 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>