28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4738 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3661  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.305414 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4738  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.88 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.43 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.48 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.89 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.4 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3748  hypothetical protein  27.12 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.582113  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.4 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.4 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.69 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.4 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  24.91 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  25 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.7 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0327  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.41 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.38 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.81 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.42 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.43 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.81 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.17 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.58 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.58 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  20.32 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>