60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  100 
 
 		 315 aa  649    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  59.15 
 
 		 302 aa  351  7e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  55.94 
 
 		 296 aa  335  7.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  53.87 
 
 		 300 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  50.7 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  45.89 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  48.07 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  47.89 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  49.3 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  50.87 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  47.28 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  49.66 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  49.31 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  49.31 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  48.95 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  43.92 
 
 		 332 aa  265  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  46.23 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  42.51 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  45.14 
 
 		 306 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  45.15 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  40 
 
 		 302 aa  211  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.2 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  35.51 
 
 		 266 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.2 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.13 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.56 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.32 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.66 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  26.78 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  20.89 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.32 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  28.72 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.32 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.16 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.46 
 
 		 280 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.73 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.81 
 
 		 285 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  24.35 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.61 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.74 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.74 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.63 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.95 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.22 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45928  predicted protein  28.48 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.57 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.4 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.46 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  22.8 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.27 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.03 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.93 
 
 		 280 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.84 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41990  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.69 
 
 		 248 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.42 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29154  predicted protein  29.91 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>