29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41990 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_41990  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.02 
 
 
295 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.53 
 
 
320 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.33 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.73 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.1 
 
 
394 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
257 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.83 
 
 
394 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  25.68 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.14 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.14 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.73 
 
 
281 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  20 
 
 
296 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.34 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.4 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.7 
 
 
302 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 
279 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.26 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  22.51 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  24.4 
 
 
298 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.64 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 
275 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  25 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  30.69 
 
 
315 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  26.7 
 
 
300 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.08 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.86 
 
 
282 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>