133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2103 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 283 aa  588  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  57.19 
 
 		 285 aa  350  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  43.94 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  41.15 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  26.61 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.98 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.93 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.72 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  25.96 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.71 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.36 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.69 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  26.12 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.64 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  24.24 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.07 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  39.06 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.96 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.79 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.62 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.99 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.62 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  25.93 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.73 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.17 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.39 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.3 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  31.1 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.27 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.17 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.53 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.75 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.74 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.22 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.69 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.14 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.17 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.39 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.12 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  26.02 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.33 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.61 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.13 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  29.71 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.27 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.76 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.11 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  26.9 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.66 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.19 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  32.65 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  32.65 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  32.65 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  32.65 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  32.65 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  32.65 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.98 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.51 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  25.19 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  25.2 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  22.71 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  25.79 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  21.35 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  26.16 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.51 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  23.87 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.53 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.43 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  26.64 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  24.39 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  23.39 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  23.11 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.64 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  22.83 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  27.66 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04647  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01850)  21.68 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  28.48 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.25 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  28.69 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.88 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  22.82 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.43 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.43 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  27.82 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.69 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.43 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.3 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.86 
 
 		 230 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  23.27 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.91 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  26.67 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  26.67 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  27.07 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  27.94 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3564  hypothetical protein  25 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0554  hypothetical protein  27.07 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.68 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.71 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>