65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5271 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  100 
 
 
304 aa  627  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  77.47 
 
 
303 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  75.18 
 
 
299 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  74.82 
 
 
299 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  74.82 
 
 
299 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  59.26 
 
 
298 aa  352  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  55.1 
 
 
300 aa  341  9e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  51.21 
 
 
296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  50.68 
 
 
302 aa  300  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  45.77 
 
 
304 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  50.7 
 
 
291 aa  281  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  47.1 
 
 
311 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  45.58 
 
 
302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  44.11 
 
 
332 aa  261  8e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  46.23 
 
 
315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  47.75 
 
 
306 aa  255  8e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  45.21 
 
 
302 aa  252  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  46.67 
 
 
306 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  45.33 
 
 
314 aa  248  9e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  41.81 
 
 
306 aa  244  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  38.38 
 
 
302 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  35.04 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.64 
 
 
268 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.99 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.99 
 
 
284 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.89 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.4 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.43 
 
 
293 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.3 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.22 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  27.53 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  24.31 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.42 
 
 
320 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.71 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.7 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.82 
 
 
283 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.1 
 
 
260 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.22 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  23.42 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.48 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.86 
 
 
257 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.51 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.51 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.19 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  25 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.48 
 
 
281 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.51 
 
 
257 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.59 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.66 
 
 
274 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  23.33 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.33 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  23.33 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  23.33 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.96 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.33 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  23.33 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.33 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.74 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.74 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.12 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.37 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.11 
 
 
299 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  27.84 
 
 
263 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.88 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.58 
 
 
267 aa  42.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>