110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0353 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
253 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  92.89 
 
 
253 aa  497  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  84.58 
 
 
253 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  72.44 
 
 
306 aa  387  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  72.44 
 
 
306 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  72.44 
 
 
306 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  72.44 
 
 
256 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  73.88 
 
 
253 aa  380  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  72.05 
 
 
306 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  72.44 
 
 
297 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  73.88 
 
 
253 aa  380  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  73.09 
 
 
257 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  72.69 
 
 
257 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  72.29 
 
 
281 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  72.29 
 
 
257 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  72.29 
 
 
257 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  72.29 
 
 
257 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  71.89 
 
 
257 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  51.44 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  51.44 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  47.15 
 
 
273 aa  251  9.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  49.79 
 
 
263 aa  242  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  44.94 
 
 
268 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  46.09 
 
 
281 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  45.42 
 
 
270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.31 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.09 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  24.58 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.66 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.44 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.05 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  23.61 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.11 
 
 
283 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.39 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  23.92 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.29 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.69 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 
303 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 
303 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.46 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.23 
 
 
282 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.23 
 
 
282 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.98 
 
 
320 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.03 
 
 
282 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.86 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.41 
 
 
283 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.61 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.14 
 
 
276 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.03 
 
 
282 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.68 
 
 
270 aa  55.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  21.95 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  24.34 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.21 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 
279 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.75 
 
 
282 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  27.06 
 
 
266 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  23.08 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.45 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.51 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.99 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.13 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.56 
 
 
372 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  26.17 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.07 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.06 
 
 
284 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  29.91 
 
 
278 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.36 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.52 
 
 
277 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.38 
 
 
275 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  25.42 
 
 
289 aa  48.9  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3519  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.76 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.95 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.32 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  24.45 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  24.38 
 
 
258 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  21.91 
 
 
314 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  21.09 
 
 
332 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.46 
 
 
293 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.75 
 
 
264 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.03 
 
 
300 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.19 
 
 
292 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  21.81 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.73 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.75 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  24.41 
 
 
276 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.32 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.89 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00150  Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH)  21.4 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04647  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01850)  25 
 
 
313 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  25.38 
 
 
308 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  19.28 
 
 
296 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  25.38 
 
 
308 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  23.62 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>