135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3118 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
257 aa  541  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.37 
 
 
320 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.6 
 
 
303 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.2 
 
 
274 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.6 
 
 
303 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.6 
 
 
303 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.34 
 
 
273 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.51 
 
 
270 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 
300 aa  99.8  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  27.98 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 
260 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.27 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.92 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.92 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.93 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.76 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  27.5 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.76 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.08 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  23.81 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.46 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.93 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.54 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.3 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.27 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  24.35 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.22 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.39 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.19 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  25 
 
 
301 aa  67  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.36 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.44 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.32 
 
 
372 aa  65.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.32 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.17 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
253 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.61 
 
 
293 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.81 
 
 
296 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.05 
 
 
394 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  21.37 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.63 
 
 
394 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.45 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.02 
 
 
306 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.69 
 
 
253 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 
265 aa  58.9  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  31.97 
 
 
297 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.03 
 
 
264 aa  58.5  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  31.97 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.78 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.97 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.27 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  28.23 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.4 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.69 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.4 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  31.97 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  31.97 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  31.97 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  23.57 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.18 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  24.48 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.53 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  27.75 
 
 
266 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  27.52 
 
 
329 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  31.15 
 
 
306 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.98 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.58 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  28.81 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  23.55 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.81 
 
 
274 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.47 
 
 
282 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  23.85 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.14 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  28.46 
 
 
299 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.65 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  20.93 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.79 
 
 
301 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  24.3 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  23.19 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.15 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.76 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  23.98 
 
 
306 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 
282 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  27.21 
 
 
278 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32238  predicted protein  23.26 
 
 
277 aa  52.4  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.194456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2960  hypothetical protein  25.78 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0605457  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  28.22 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  20.78 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.81 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  23.43 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.41 
 
 
283 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.08 
 
 
302 aa  49.7  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.773744 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04647  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01850)  22.89 
 
 
313 aa  48.9  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.79 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0855304 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>