46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4420 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  100 
 
 
299 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  98.33 
 
 
299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  98.33 
 
 
299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  75.18 
 
 
304 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  72.98 
 
 
303 aa  441  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  58.19 
 
 
298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  56.01 
 
 
300 aa  335  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  53.47 
 
 
296 aa  311  9e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  49.67 
 
 
302 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  51.02 
 
 
291 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  45.54 
 
 
311 aa  278  9e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  49.66 
 
 
315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  45.96 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  45.8 
 
 
302 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  47.39 
 
 
302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  48.42 
 
 
306 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  46.34 
 
 
306 aa  249  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  44.1 
 
 
332 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  46.13 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  40.91 
 
 
306 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  38.68 
 
 
302 aa  209  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.2 
 
 
274 aa  148  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  35.54 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.95 
 
 
268 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.7 
 
 
284 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.14 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 
264 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.27 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  24.18 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.35 
 
 
259 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.53 
 
 
285 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.94 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.56 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.04 
 
 
260 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  22.67 
 
 
300 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.65 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.55 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.09 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.09 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.31 
 
 
275 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.7 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.09 
 
 
257 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.12 
 
 
279 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  24.43 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.547495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>