107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1903 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 254 aa  527  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.8 
 
 		 280 aa  85.9  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.13 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.52 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.03 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.76 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.52 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.12 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  27.19 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.48 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.81 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  31.74 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.61 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.29 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.18 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  22.88 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.11 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.75 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.53 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.7 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.7 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.11 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  24.52 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.3 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.42 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  23.48 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.93 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.92 
 
 		 293 aa  62  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.54 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.45 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.15 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.52 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.27 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59203  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.11 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.23 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.76 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_7544  predicted protein  34.45 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  29.5 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.12 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  22.22 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 		 394 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  30.33 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0554  hypothetical protein  27.17 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  22.95 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.56 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.56 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  22.22 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  21.79 
 
 		 329 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04647  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01850)  27.78 
 
 		 313 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.48 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.07 
 
 		 372 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  24.77 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  25.74 
 
 		 307 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.64 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  26.83 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0935  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.5 
 
 		 313 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2678  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.48 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  25.74 
 
 		 352 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  25.74 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  25.74 
 
 		 354 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35257  predicted protein  29.46 
 
 		 296 aa  48.9  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109347  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  29.84 
 
 		 326 aa  48.9  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  27.01 
 
 		 268 aa  48.9  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  25.42 
 
 		 287 aa  48.5  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0320  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.63 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  26.58 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  24.31 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.36 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  23.68 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  26.15 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1647  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.02 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  23.71 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.5 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0888  hypothetical protein  22.63 
 
 		 300 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.475505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.96 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.98 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3519  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.6 
 
 		 295 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6836  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.78 
 
 		 277 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0909403  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  22.51 
 
 		 296 aa  45.4  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3328  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.74 
 
 		 269 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2735  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.83 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.51 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.58 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.3 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  23.23 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  23.23 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  23.23 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.23 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  23.23 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.23 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.48 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3969  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.95 
 
 		 382 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.24 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5816  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.52 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>