120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3014 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  57.78 
 
 		 278 aa  330  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  44.75 
 
 		 280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.19 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  37.57 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.38 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  25.28 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  25.28 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  24.33 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.48 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  25.27 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  28.04 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  28.11 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  28.11 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  26.27 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  28.11 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  26.27 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  26.11 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  28.57 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3783  hypothetical protein  26.27 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.77 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.41 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.44 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  27.57 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  31.41 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.07 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  41.77 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.56 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.45 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.94 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.94 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.19 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.14 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.87 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.51 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.54 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  24.06 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  24.06 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.06 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.06 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.7 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  31.51 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.46 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.48 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.75 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  27.51 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.08 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.67 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.11 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  31.62 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  24.14 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.21 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.79 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  22.73 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  24.66 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.7 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.83 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.55 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.94 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.45 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  25.52 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.37 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.37 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04647  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01850)  28.78 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.82 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.37 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.37 
 
 		 282 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.37 
 
 		 282 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.37 
 
 		 282 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.29 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59203  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.35 
 
 		 230 aa  49.3  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.97 
 
 		 306 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  32.95 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.14 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.77 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  24.9 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.58 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.03 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.58 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2678  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.7 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.91 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.73 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.73 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  27.4 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.41 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  25.32 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  27.61 
 
 		 302 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  25.32 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25.32 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  25.32 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_7544  predicted protein  33.63 
 
 		 135 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  25.32 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25.32 
 
 		 297 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.81 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.22 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>