87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4972 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 277 aa  576  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.84 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.6 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.44 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.49 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  31.72 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.73 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_85999  predicted protein  30.41 
 
 		 407 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.21 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.21 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48320  predicted protein  28.37 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.47 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.84 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.54 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.54 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.47 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.67 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.44 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.19 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.51 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.81 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.23 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.05 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.68 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  28.57 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  25.78 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.14 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  26.28 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.76 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.76 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.94 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.87 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.66 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.29 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  26.32 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.03 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.72 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.03 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.03 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.05 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.3 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.75 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.48 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  30.95 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  30.95 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.54 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.95 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  30.95 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  30.95 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  30.95 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.01 
 
 		 306 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  30.95 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.98 
 
 		 230 aa  52.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.01 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.97 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.09 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2678  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  22.94 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.63 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59203  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.03 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  25.76 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  24.24 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.67 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.52 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.52 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.52 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.52 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.47 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.93 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.4 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  24.42 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.33 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  25.21 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.7 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.51 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.75 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  26.11 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.72 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3519  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.91 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.613414 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>