57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4837 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 267 aa  550  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.84 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.3 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.36 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.97 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.91 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  33.55 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.08 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.3 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.67 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  26.89 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.49 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.07 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.39 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_85999  predicted protein  24.78 
 
 		 407 aa  67  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.25 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.76 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.44 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.05 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.94 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.33 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48320  predicted protein  23.74 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.07 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.51 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.08 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.7 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.7 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.17 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.01 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  26.51 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.62 
 
 		 283 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.5 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 303 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 303 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.76 
 
 		 320 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  23.85 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.07 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.62 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.04 
 
 		 394 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.64 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.73 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.26 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.73 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  23.81 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.23 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.78 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.37 
 
 		 306 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5713  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.43 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  25.2 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>