72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2518 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 276 aa  552  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.77 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.09 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.43 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  32.46 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.82 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.32 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.01 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  24.74 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.33 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.67 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.6 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.89 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_85999  predicted protein  27.09 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.85 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.67 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.24 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.61 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.03 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.69 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.69 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.41 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.67 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.69 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.02 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.35 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.1 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.1 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  26.94 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  26.94 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  26.94 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  30.77 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.67 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.94 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.27 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  32.76 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.65 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.31 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.29 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.65 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.65 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.86 
 
 		 282 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.93 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.17 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.09 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.36 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  30.43 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.65 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48320  predicted protein  31.54 
 
 		 410 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  30.91 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.36 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.21 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.31 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.36 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  26.47 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.4 
 
 		 320 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.33 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  25.16 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.84 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  32.71 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4291  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.63 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.768116  hitchhiker  0.00438427 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35257  predicted protein  26.39 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109347  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.31 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  26.98 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_7544  predicted protein  31 
 
 		 135 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.35 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.37 
 
 		 266 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>