30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48320 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48320  predicted protein  100 
 
 		 410 aa  846    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_85999  predicted protein  30.84 
 
 		 407 aa  146  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.37 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.74 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.3 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.51 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.77 
 
 		 269 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.18 
 
 		 282 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.2 
 
 		 282 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.77 
 
 		 282 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  27.98 
 
 		 278 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.65 
 
 		 284 aa  53.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  27.98 
 
 		 266 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.79 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.79 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.79 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.84 
 
 		 282 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.84 
 
 		 282 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.54 
 
 		 276 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.65 
 
 		 282 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.82 
 
 		 279 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.73 
 
 		 283 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.78 
 
 		 253 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.29 
 
 		 274 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.72 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  26.71 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.79 
 
 		 266 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.72 
 
 		 280 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.45 
 
 		 264 aa  43.5  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>