95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2811 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  98.22 
 
 		 394 aa  787    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 394 aa  798    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.43 
 
 		 284 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.02 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.68 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.68 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.11 
 
 		 282 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.03 
 
 		 283 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.58 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  28.51 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.08 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.73 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.31 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.07 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0615  hypothetical protein  38.52 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.25162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.19 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.83 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.75 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.82 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.88 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  24.82 
 
 		 278 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.41 
 
 		 266 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  30.08 
 
 		 287 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  25.1 
 
 		 266 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.94 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 320 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.41 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.68 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  26.07 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.54 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.05 
 
 		 257 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.67 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.89 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.64 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.64 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.68 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  24.29 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.73 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  27.52 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 239 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.21 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.23 
 
 		 274 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.85 
 
 		 268 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  28.8 
 
 		 263 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35257  predicted protein  30.72 
 
 		 296 aa  53.9  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109347  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.86 
 
 		 275 aa  53.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.03 
 
 		 260 aa  52.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  26.07 
 
 		 271 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  31.4 
 
 		 241 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.71 
 
 		 283 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.83 
 
 		 258 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_7544  predicted protein  31.45 
 
 		 135 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.42 
 
 		 280 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.63 
 
 		 267 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.67 
 
 		 305 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.67 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41990  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.1 
 
 		 248 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.31 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.16 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.16 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.18 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.44 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.36 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.61 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04647  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01850)  28.57 
 
 		 313 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  23.91 
 
 		 301 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.12 
 
 		 230 aa  46.6  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3366  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.89 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  26.42 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  28.67 
 
 		 276 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.23 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.5 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.81 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  27.89 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.89 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.26 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.5 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  24.84 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.36 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.12 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  30.16 
 
 		 297 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  24.84 
 
 		 281 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.16 
 
 		 306 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  30.16 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  30.16 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  30.16 
 
 		 253 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  30.16 
 
 		 253 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  30.16 
 
 		 256 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  25.62 
 
 		 268 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.54 
 
 		 295 aa  43.1  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 257 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  37.5 
 
 		 273 aa  43.1  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.77 
 
 		 275 aa  43.1  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>