103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6979 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  100 
 
 
263 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  58.02 
 
 
260 aa  289  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  51.46 
 
 
253 aa  236  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.16 
 
 
270 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.8 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.72 
 
 
277 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.46 
 
 
276 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.98 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.52 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.51 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.1 
 
 
394 aa  82  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 
300 aa  82  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.35 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.32 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  27.49 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.37 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.7 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.32 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.32 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.41 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.26 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.64 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.07 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.07 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.89 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.44 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.44 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.44 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.54 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.78 
 
 
279 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.51 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.51 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.79 
 
 
283 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  33.78 
 
 
263 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.72 
 
 
280 aa  58.9  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.8 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.43 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.19 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  22.34 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  26.79 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  25.32 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.37 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.24 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.96 
 
 
263 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.96 
 
 
263 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  23.78 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  21 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.67 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.16 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.11 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.74 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.2 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.73 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.24 
 
 
266 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  23.47 
 
 
254 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  25.12 
 
 
266 aa  52.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.69 
 
 
259 aa  52  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 
273 aa  52  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  24.77 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.92 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.82 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  26.86 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.92 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.21 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.21 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  28.35 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.79 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.36 
 
 
281 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  28.79 
 
 
306 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  25.84 
 
 
276 aa  48.9  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.79 
 
 
306 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.09 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.79 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.79 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.45 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.15 
 
 
254 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.21 
 
 
306 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  28.03 
 
 
297 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  28.03 
 
 
306 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  28.03 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  28.03 
 
 
253 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  28.03 
 
 
253 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.22 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  25 
 
 
287 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.62 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  24.71 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48742  predicted protein  24.64 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526159  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  24.46 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  24.33 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  24.07 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  22.47 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  22.41 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  24.86 
 
 
300 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.92 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  24.25 
 
 
308 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  24.25 
 
 
308 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3519  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.04 
 
 
295 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.613414 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  24.64 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.880107 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>