79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2245 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  95.49 
 
 
278 aa  533  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  70.61 
 
 
279 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  68.7 
 
 
284 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  64.12 
 
 
274 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  63.32 
 
 
283 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  62.16 
 
 
282 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  62.26 
 
 
282 aa  341  8e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  61.78 
 
 
282 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  61.78 
 
 
282 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  61 
 
 
282 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  61 
 
 
282 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  39.92 
 
 
266 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  41.98 
 
 
287 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  40.94 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.45 
 
 
278 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3366  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.43 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.57 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4327  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.57 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.0438049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5715  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.97 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2735  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.05 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5713  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.15 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6836  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.46 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0909403  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4363  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.91 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5816  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.64 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5044  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.64 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.81 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 
394 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.34 
 
 
394 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.63 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 
320 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.26 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.75 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.22 
 
 
293 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.64 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.86 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43737  phytanoyl-coa dioxygenase  21.82 
 
 
409 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.6 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.82 
 
 
253 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.91 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.13 
 
 
273 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.31 
 
 
275 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  25.12 
 
 
263 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.82 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.77 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48320  predicted protein  27.98 
 
 
410 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.72 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.19 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  40 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  40 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  40 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.79 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.81 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.35 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.81 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 
306 aa  49.3  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  31.62 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  31.62 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  31.62 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  31.62 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.81 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.5 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  31.62 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.62 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.35 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 
306 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  30.77 
 
 
306 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  29.06 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_85999  predicted protein  22.59 
 
 
407 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.12 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  23.56 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  26.95 
 
 
263 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  21.33 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>