144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2862 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 268 aa  555  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.56 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.8 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.11 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.45 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  32.42 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.38 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.19 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28 
 
 		 300 aa  90.1  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  31.89 
 
 		 326 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.54 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.12 
 
 		 239 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.74 
 
 		 293 aa  85.5  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.59 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.87 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.64 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.5 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  26.82 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  29.22 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  29.22 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  29.22 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.31 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  30 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  29.3 
 
 		 308 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  29.3 
 
 		 308 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.22 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.22 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.93 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  23.48 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.57 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.57 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.32 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  24.82 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.06 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  25.28 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  32.18 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  25.28 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  25.28 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  25.67 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  28.29 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.46 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  25.29 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  24.83 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  24.14 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.94 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.94 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.54 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.94 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.29 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.34 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  23.21 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  31.71 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.94 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.5 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  27.67 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.2 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6047  hypothetical protein  26.59 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.13518  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.69 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.47 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.03 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  26.85 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.98 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.23 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.53 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.26 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  29.03 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.93 
 
 		 372 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.77 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.85 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.22 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3564  hypothetical protein  27.78 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  25.84 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.03 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  31.29 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  28.39 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  28.39 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  28.39 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  28.39 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  28.39 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  22.43 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.85 
 
 		 394 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  26.75 
 
 		 311 aa  52.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.39 
 
 		 306 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  22.35 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  29.61 
 
 		 315 aa  52.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3783  hypothetical protein  23.65 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  27.81 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  25.19 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.93 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.84 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  27.11 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.79 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.71 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  27.67 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>