145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0567 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
261 aa  535  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.14 
 
 
260 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.89 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.45 
 
 
268 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  27.8 
 
 
276 aa  99  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.22 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  27.03 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.69 
 
 
320 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.31 
 
 
285 aa  92.8  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.22 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.21 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  27.5 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.12 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.99 
 
 
300 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  27 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.38 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.81 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.93 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.59 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.47 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  27.39 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  29.76 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.91 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.71 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.71 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  27.42 
 
 
296 aa  75.5  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  32.68 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  26.41 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.52 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.88 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.27 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.15 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.27 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.41 
 
 
278 aa  72  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  36 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.92 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.14 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.8 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  26.02 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.81 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35257  predicted protein  29.81 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109347  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  26.16 
 
 
298 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.57 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  40.26 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  33.33 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  32.79 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.68 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.97 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  28.57 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  34.68 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.41 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.24 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.87 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  33.87 
 
 
297 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.9 
 
 
372 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  33.87 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  33.87 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  33.87 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  33.87 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  20.91 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.93 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  23.99 
 
 
299 aa  62.4  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  31.85 
 
 
254 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.67 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.03 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  23.72 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.72 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  20.68 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.01 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.21 
 
 
394 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.21 
 
 
394 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  36.92 
 
 
302 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  25.83 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43737  phytanoyl-coa dioxygenase  25.62 
 
 
409 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  23.31 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_85999  predicted protein  24.35 
 
 
407 aa  52  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  27.2 
 
 
310 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0554  hypothetical protein  27.2 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  19.49 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.75 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  25.6 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.74 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.31 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.05 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.03 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.67 
 
 
285 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.46 
 
 
272 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  28.17 
 
 
326 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>